RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	TFDP1	Q14186	410 aa		16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	SLC29A2	Q14542	456 aa		16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	PSMD6	Q15008	389 aa		16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	MTFR1	Q15390	333 aa		16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	MORN1	Q5T089	497 aa		16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEB18	Q96M61	343 aa		16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		16.16	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	INSRR	P14616	1297 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	GPC3	P51654	580 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	MAP2K5	Q13163	448 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	SV2A	Q7L0J3	742 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	RNF149	Q8NC42	400 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	SEMA4D	Q92854	862 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	PTPRN2	Q92932	1015 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF333	Q96JL9	665 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	RIPK2	O43353	540 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	MSC	O60682	206 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	C22orf31	O95567	290 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	ITGA4	P13612	1032 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	ACOT2	P49753	483 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	POLE2	P56282	527 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	PPARD	Q03181	441 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	NCSTN	Q92542	709 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	FNBP1	Q96RU3	617 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	RAB20	Q9NX57	234 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	NAGPA	Q9UK23	515 aa		16.15	■□□□□ 0.18
BBS1-225	ENST00000630659	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEB2	O15479	319 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	FGG	P02679	453 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	PRKCB	P05771	671 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	SLC10A3	P09131	477 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	CHRNA3	P32297	505 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	TUB	P50607	506 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	IGBP1	P78318	339 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	CLDN10	P78369	228 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	KIF22	Q14807	665 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	MAPK6	Q16659	721 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	H2AFV	Q71UI9	128 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	IFNL1	Q8IU54	200 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	FAM13C	Q8NE31	585 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	GBP5	Q96PP8	586 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	NENF	Q9UMX5	172 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	COL1A2	P08123	1366 aa		16.14	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF286B	P0CG31	522 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	PYGB	P11216	843 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	CLCN3	P51790	818 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	MFAP3	P55082	362 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	C17orf99	Q6UX52	265 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	VSIG1	Q86XK7	387 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	JAML	Q86YT9	394 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	NT5C1B	Q96P26	610 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	MIS12	Q9H081	205 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM120B	A0PK00	339 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	CLDN3	O15551	220 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	TOM1L1	O75674	476 aa		16.13	■□□□□ 0.17
BBS1-225	ENST00000630659	MMP3	P08254	477 aa		16.13	■□□□□ 0.17

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