RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 GPD2P43304 727 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa26.39■■□□□ 1.82
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CAPNS1-215ENST00000628018 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 UVRAGQ9P2Y5 699 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 CYTH4Q9UIA0 394 aa26.39■■□□□ 1.82
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CAPNS1-215ENST00000628018 C2CD6Q53TS8 623 aa26.39■■□□□ 1.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 LIN9Q5TKA1 542 aa26.38■■□□□ 1.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 L2HGDHQ9H9P8 463 aa26.38■■□□□ 1.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 UBA3Q8TBC4 463 aa26.37■■□□□ 1.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF37A1IGU5 675 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 TBKBP1A7MCY6 615 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 TTC30AQ86WT1 665 aa26.36■■□□□ 1.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 RTP3Q9BQQ7 232 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM175Q9BSA9 504 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 TLR10Q9BXR5 811 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLPH3Q9H4A6 298 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 HESX1Q9UBX0 185 aa26.34■■□□□ 1.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa26.34■■□□□ 1.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 COL4A6Q14031 1691 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 GABRB2P47870 512 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 GSCP56915 257 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC2A14Q8TDB8 520 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35F5Q8WV83 523 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 C18orf8Q96DM3 657 aa26.33■■□□□ 1.81
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