RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 AKR1B1P15121 316 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 RFFLQ8WZ73 363 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 MIEF2Q96C03 454 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 VAV3Q9UKW4 847 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 GRID1Q9ULK0 1009 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 MAGEA13PA6NCF6 341 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 BCAP31P51572 246 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 NME5P56597 212 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CDH16O75309 829 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 RGS7P49802 495 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CHRNB3Q05901 458 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CNPY4Q8N129 248 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 DCAF4Q8WV16 495 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TRAPPC3O43617 180 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CIAO1O76071 339 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 MAGED4Q96JG8 741 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF560Q96MR9 790 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC9A7Q96T83 725 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 MLH3Q9UHC1 1453 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CYP21A2P08686 494 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 PDGFRBP09619 1106 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SSH3Q8TE77 659 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF333Q96JL9 665 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLPH3Q9H4A6 298 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 LSP1P33241 339 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF284Q2VY69 593 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 S100A13Q99584 98 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 NUP160Q12769 1436 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 MEI4A8MW99 385 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ASNSP08243 561 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 LGALS3BPQ08380 585 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 MROH9Q5TGP6 573 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 KIAA0408Q6ZU52 694 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 NMRK2Q9NPI5 230 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 FEM1BQ9UK73 627 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CYP26A1O43174 497 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TSNQ15631 228 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 KCTD10Q9H3F6 313 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 GH2P01242 217 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CYP2C19P33261 490 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 QARSP47897 775 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SYTL1Q8IYJ3 562 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 AGPAT1Q99943 283 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 RMND5AQ9H871 391 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ANO9A1A5B4 782 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 PMF1Q6P1K2 205 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CAMKK2Q96RR4 588 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SIK3Q9Y2K2 1263 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 BTN3A3O00478 584 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CYP4A22Q5TCH4 519 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRC1Q9BTT6 524 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 UBXN6Q9BZV1 441 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 KLHL4Q9C0H6 718 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 GRAP2O75791 330 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 HOXD10P28358 340 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 H7C0S8 307 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CLTBP09497 229 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 LBPP18428 481 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SMTNL2Q2TAL5 461 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 MFSD14CQ5VZR4 134 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 C2orf69Q8N8R5 385 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 LXNQ9BS40 222 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 FOXP3Q9BZS1 431 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CYP7B1O75881 506 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ALOX12P18054 663 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 WEE2P0C1S8 567 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 HARS2P49590 506 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 MTM1Q13496 603 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 AGAP9Q5VTM2 703 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SCFD2Q8WU76 684 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SEPT1Q8WYJ6 367 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TBC1D22BQ9NU19 505 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 PDP2Q9P2J9 529 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 MGAT4DA6NG13 374 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 BCL10O95999 233 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 KCNJ6P48051 423 aa19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms