RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602511.1

KDM5B-210, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM5B, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-210ENST00000602511 LAG3P18627 525 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PPM1AP35813 382 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 RAP1GAPP47736 663 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 NDST1P52848 882 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 CDH8P55286 799 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 CENPCQ03188 943 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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KDM5B-210ENST00000602511 TCEAL1Q15170 157 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
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KDM5B-210ENST00000602511 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM240Q5SV17 173 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 RASIP1Q5U651 963 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 CD300LGQ6UXG3 332 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 KIAA1328Q86T90 577 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF280BQ86YH2 543 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ACBD6Q9BR61 282 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 MIS12Q9H081 205 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 SNX25Q9H3E2 840 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 CWH43Q9H720 699 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 CYLDQ9NQC7 956 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 CDH9Q9ULB4 789 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 NCANO14594 1321 aa8.7□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.021e-10■■■■■ 44.3
KDM5B-210ENST00000602511 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ANKRD62A6NC57 917 aa8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 A8MXQ7 604 aa8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 O00370 1275 aa8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 NRP1O14786 923 aa8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF263O14978 683 aa8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 B4GALT3O60512 393 aa8.69□□□□□ -1.02
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KDM5B-210ENST00000602511 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.69□□□□□ -1.02
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KDM5B-210ENST00000602511 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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KDM5B-210ENST00000602511 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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KDM5B-210ENST00000602511 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.69□□□□□ -1.02
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KDM5B-210ENST00000602511 OR6B3Q8NGW1 331 aa8.69□□□□□ -1.02
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KDM5B-210ENST00000602511 SLC20A1Q8WUM9 679 aa8.69□□□□□ -1.02
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KDM5B-210ENST00000602511 TWNKQ96RR1 684 aa8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 38.5
KDM5B-210ENST00000602511 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 AAASQ9NRG9 546 aa8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 MARCH5Q9NX47 278 aa8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 INSL6Q9Y581 213 aa8.69□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 OBSL1O75147 1896 aa8.68□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 OR6C75A6NL08 312 aa8.68□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 TADA2AO75478 443 aa8.68□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 UPP2O95045 317 aa8.68□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ACRP10323 421 aa8.68□□□□□ -1.02
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