RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592515.1

UBXN6-209, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN6, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-209ENST00000592515 PTPN5P54829 565 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 DLG4P78352 724 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 NHLH1Q02575 133 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 FAM160A1Q05DH4 1040 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 BIRC3Q13489 604 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 TRPC3Q13507 836 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 PNOCQ13519 176 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 WDR72Q3MJ13 1102 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 CEP135Q66GS9 1140 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 FAM171BQ6P995 826 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 CCDC34Q96HJ3 373 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 MMS19Q96T76 1030 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 SYT15Q9BQS2 421 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 MKNK1Q9BUB5 465 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 GPR88Q9GZN0 384 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 ATXN3LQ9H3M9 355 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 TRPV4Q9HBA0 871 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 ABCB6Q9NP58 842 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 CDH9Q9ULB4 789 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 NME7Q9Y5B8 376 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 NCANO14594 1321 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 STK25O00506 426 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 PHACTR2O75167 634 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 TACC1O75410 805 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 FGF19O95750 216 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 PDGFRBP09619 1106 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 RFX1P22670 979 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 NR2F2P24468 414 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 ATICP31939 592 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 TNNC1P63316 161 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 PFKPQ01813 784 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 GRM2Q14416 872 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 NFIL3Q16649 462 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 DDR2Q16832 855 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 CFAP221Q4G0U5 840 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 SLC44A4Q53GD3 710 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 SDHAF4Q5VUM1 108 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 VITQ6UXI7 678 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 STKLD1Q8NE28 680 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 TMC2Q8TDI7 906 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 RSPRY1Q96DX4 576 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 CRTAC1Q9NQ79 661 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 AKAP3O75969 853 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 VNN1O95497 513 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 FAM163BP0C2L3 166 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 PSMC3P17980 439 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 CDC25CP30307 473 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 STARD6P59095 220 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 CYP4F8P98187 520 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 NCOA4Q13772 614 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 TAF12Q16514 161 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 ZACNQ401N2 412 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 ZCWPW2Q504Y3 356 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 C1orf220Q5T0J3 134 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 GPR158Q5T848 1215 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 TMEM150AQ86TG1 271 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 GPIHBP1Q8IV16 184 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 MYLPFQ96A32 169 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 ELMO3Q96BJ8 720 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 SHDQ96IW2 340 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 FOXQ1Q9C009 403 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 SNX25Q9H3E2 840 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 VRTNQ9H8Y1 702 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 RMND1Q9NWS8 449 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 COL4A3Q01955 1670 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 HEPACAM2A8MVW5 462 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 MAPK13O15264 365 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 NOL4O94818 638 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 F11P03951 625 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 CSH1P0DML2 217 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 CSH2P0DML3 217 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 MAGEA11P43364 429 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 NLRP12P59046 1061 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 PRKCQQ04759 706 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 ADAM9Q13443 819 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 ZNF699Q32M78 642 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 C4orf50Q6ZRC1 276 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 SV2AQ7L0J3 742 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 MFSD6LQ8IWD5 586 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN6-209ENST00000592515 CCDC105Q8IYK2 499 aa13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms