RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF560Q96MR9 790 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 TDP1Q9NUW8 608 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 IL18RAPO95256 599 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNA1Q09470 495 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 SCARA3Q6AZY7 606 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 PDCL2Q8N4E4 241 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 HVCN1Q96D96 273 aa27.62■■■□□ 2.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 STRA6Q9BX79 667 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF9Q9HAQ2 790 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 KBTBD6Q86V97 674 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 NT5DC4Q86YG4 428 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM84AQ96KN4 292 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM213AQ9BRX8 229 aa27.61■■■□□ 2.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 CSH2P0DML3 217 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 PNPLA4P41247 253 aa27.6■■■□□ 2.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf127Q8N9H9 656 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC8A2Q9UPR5 921 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 EPN2O95208 641 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGB3P05106 788 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNA4P22459 653 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 POSTNQ15063 836 aa27.59■■■□□ 2.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 DDR2Q16832 855 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC142Q17RM4 750 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 BRSK2Q8IWQ3 736 aa27.59■■■□□ 2.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 PKMYT1Q99640 499 aa27.59■■■□□ 2.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D7Q9P0N9 293 aa27.59■■■□□ 2.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 ATG13O75143 517 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC192P0DO97 292 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2F1P24903 491 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 EPG5Q9HCE0 2579 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 MYMKA6NI61 221 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 SOBPA7XYQ1 873 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 NOL4O94818 638 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 GALK1P51570 392 aa27.57■■■□□ 2
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CAPNS1-211ENST00000590874 PDGFRLQ15198 375 aa27.57■■■□□ 2
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CAPNS1-211ENST00000590874 STK17AQ9UEE5 414 aa27.57■■■□□ 2
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CAPNS1-211ENST00000590874 CLIC4Q9Y696 253 aa27.57■■■□□ 2
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CAPNS1-211ENST00000590874 GJA4P35212 333 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 CASP5P51878 434 aa27.56■■■□□ 2
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CAPNS1-211ENST00000590874 OSTM1Q86WC4 334 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC19Q96DA6 116 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 ACCSQ96QU6 501 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A12Q96S37 553 aa27.56■■■□□ 2
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