RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580799.2

GGA3-210, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5

Gene GGA3, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-210	ENST00000580799	FBXO43	Q4G163	708 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	MON1A	Q86VX9	555 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	LRRC15	Q8TF66	581 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	TMX3	Q96JJ7	454 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ABCB6	Q9NP58	842 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	SPTBN2	O15020	2390 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	TISP43	B9A030	160 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	AXIN1	O15169	862 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	CCDC192	P0DO97	292 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	DDIT3	P35638	169 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	CPA6	Q8N4T0	437 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	SPATA18	Q8TC71	538 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	CHFR	Q96EP1	664 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	MYRFL	Q96LU7	910 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ACBD6	Q9BR61	282 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	STK17A	Q9UEE5	414 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	TM4SF5	O14894	197 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	HUS1	O60921	280 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	RNF40	O75150	1001 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	PPP1R37	O75864	691 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	GAP43	P17677	238 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ADSS	P30520	456 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	CDR1	P51861	262 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	MYL7	Q01449	175 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	TXNDC8	Q6A555	127 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	SYT13	Q7L8C5	426 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	KBTBD6	Q86V97	674 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	SFR1	Q86XK3	245 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ATP2A3	Q93084	1043 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	TMEM206	Q9H813	350 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	VPS45	Q9NRW7	570 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	EML5	Q05BV3	1969 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	NOL4	O94818	638 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	EGF	P01133	1207 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ITGB3	P05106	788 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	CKM	P06732	381 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	USP17L7	P0C7H9	530 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ARSA	P15289	507 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	HOXC13	P31276	330 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	GJA4	P35212	333 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	MPL	P40238	635 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	GALK1	P51570	392 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	NR1H3	Q13133	447 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ALCAM	Q13740	583 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	MTF1	Q14872	753 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	ELF2	Q15723	593 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	C8orf34	Q49A92	452 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA3-210	ENST00000580799	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		11.05	□□□□□ -0.64

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