RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RIMKLBQ9ULI2 386 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 EDARQ9UNE0 448 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CARD8Q9Y2G2 431 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NR2E1Q9Y466 385 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SPO11Q9Y5K1 396 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NCAPD3P42695 1498 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF804BA4D1E1 1349 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 B4DLN1 442 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MASP2O00187 686 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 AP3B1O00203 1094 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CETN3O15182 167 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SLC7A4O43246 635 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MGEA5O60502 916 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 KCNJ13O60928 360 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RTN2O75298 545 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RFPL1O75677 317 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PALMO75781 387 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 USP1O94782 785 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 REC8O95072 547 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 DNTTP04053 509 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TOP1P11387 765 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 HSD3B1P14060 373 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 KRT4P19013 534 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MSNP26038 577 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ELF1P32519 619 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ETFBP38117 255 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 HADHAP40939 763 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ECE1P42892 770 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 KCNJ6P48051 423 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CD83Q01151 205 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 COL10A1Q03692 680 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GRIN1Q05586 938 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NFYCQ13952 458 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM14Q14142 442 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC14Q49A88 953 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 C2orf27AQ580R0 203 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC183Q5T5S1 534 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 LIN54Q6MZP7 749 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RETSATQ6NUM9 610 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 C11orf88Q6PI97 169 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 LPCAT2Q7L5N7 544 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ATG9AQ7Z3C6 839 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 KDELC2Q7Z4H8 507 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA24Q86W54 205 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CEP57Q86XR8 500 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC83Q8IWF9 413 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PPIL6Q8IXY8 311 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 FAM186BQ8IYM0 893 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 PIBF1Q8WXW3 757 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GCC1Q96CN9 775 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PI4K2AQ9BTU6 479 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TRPV6Q9H1D0 765 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CDIP1Q9H305 208 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CLSTN2Q9H4D0 955 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PARVGQ9HBI0 331 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GPR108Q9NPR9 543 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TLR9Q9NR96 1032 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL11Q9NVR0 708 aa3.31□□□□□ -1.88
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