RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CLIC2O15247 247 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CCNE1P24864 410 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 GPR15P49685 360 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CYP2J2P51589 502 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 RESP18Q5W5W9 173 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 ATL3Q6DD88 541 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 OSTM1Q86WC4 334 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 HPDLQ96IR7 371 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 LHX1P48742 406 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 FZD5Q13467 585 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 STKLD1Q8NE28 680 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 TTC8Q8TAM2 541 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 UBE4BO95155 1302 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 ARNTLO00327 626 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 TGFB1I1O43294 461 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 HCRTO43612 131 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 PRAMEF12O95522 483 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 TNNI1P19237 187 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CYP2F1P24903 491 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 PCSK1P29120 753 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CUL4BQ13620 913 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 DDR2Q16832 855 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 WDR49Q8IV35 697 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA18Q8TC71 538 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 FNBP1Q96RU3 617 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 OBP2AQ9NY56 170 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.48■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 KINO60870 393 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CSH1P0DML2 217 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CSH2P0DML3 217 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 SOX9P48436 509 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 NLRP12P59046 1061 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 MTAPQ13126 283 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 TSSK4Q6SA08 328 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 HINFPQ9BQA5 517 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CFAP54Q96N23 3096 aa22.47■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 GABRDO14764 452 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 F11P03951 625 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 EHHADHQ08426 723 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC142Q17RM4 750 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 DPH6Q7L8W6 267 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 MMS19Q96T76 1030 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CHRDQ9H2X0 955 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 ABCB6Q9NP58 842 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 PTPRDP23468 1912 aa22.46■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.45■■□□□ 1.18
PPP4C-211ENST00000567642 WEE1P30291 646 aa22.45■■□□□ 1.18
PPP4C-211ENST00000567642 AVPR1AP37288 418 aa22.45■■□□□ 1.18
PPP4C-211ENST00000567642 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PPP4C-211ENST00000567642 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PPP4C-211ENST00000567642 CYP24A1Q07973 514 aa22.45■■□□□ 1.18
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.45■■□□□ 1.18
PPP4C-211ENST00000567642 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.45■■□□□ 1.18
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