RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	EXOC3	O60645	756 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MYL1	P05976	194 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CSH1	P0DML2	217 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CSH2	P0DML3	217 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	GLUL	P15104	373 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PCSK1	P29120	753 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CDC25C	P30307	473 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SYK	P43405	635 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP24A1	Q07973	514 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	STK4	Q13043	487 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	OSTM1	Q86WC4	334 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CGRRF1	Q99675	332 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	TASP1	Q9H6P5	420 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ABCB6	Q9NP58	842 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	HPSE	Q9Y251	543 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	NOTCH4	Q99466	2003 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CHAD	O15335	359 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PHACTR2	O75167	634 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM163B	P0C2L3	166 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP2F1	P24903	491 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	LMO2	P25791	158 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	WEE1	P30291	646 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MAGEA9	P43362	315 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR15	P49685	360 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFA8	P51970	172 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP4F8	P98187	520 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	TRPC3	Q13507	836 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	DDR2	Q16832	855 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM171B	Q6P995	826 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM3C	Q92520	227 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF516	Q92618	1163 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PKMYT1	Q99640	499 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	IL21	Q9HBE4	155 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	OBP2A	Q9NY56	170 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CDH9	Q9ULB4	789 aa		10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1W2PQ27	194 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1W2PQ64	194 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1W2PQD8	194 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PDXK	O00764	312 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	LAMTOR5	O43504	91 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	HCRT	O43612	131 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP2C2	O75185	946 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KIF20A	O95235	890 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	F11	P03951	625 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PDGFRB	P09619	1106 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SP9	P0CG40	484 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ATIC	P31939	592 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	AP3M2	P53677	418 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	NLRP12	P59046	1061 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	BECN1	Q14457	450 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	FSIP1	Q8NA03	581 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CLDN23	Q96B33	292 aa		10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SYT15	Q9BQS2	421 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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