RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560553.1

MFGE8-213, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 4

Gene MFGE8, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-213ENST00000560553 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 TRPV4Q9HBA0 871 aa9.77□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.77□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.77□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.77□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 A0A1B0GVL5 298 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 TGFB1I1O43294 461 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 CLSTN1O94985 981 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 PRAMEF12O95522 483 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 FGF19O95750 216 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 SP9P0CG40 484 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 CDC25CP30307 473 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 SOX9P48436 509 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 EHHADHQ08426 723 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 SMARCB1Q12824 385 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 MYO1EQ12965 1108 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 SURF1Q15526 300 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 DDR2Q16832 855 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 WDR49Q8IV35 697 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 TTC8Q8TAM2 541 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 CCDC127Q96BQ5 260 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 ZFYVE19Q96K21 471 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 IL21Q9HBE4 155 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 EXOC1Q9NV70 894 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.76□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 ATG2BQ96BY7 2078 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 SHISA7A6NL88 538 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 SLC38A8A6NNN8 435 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 MAN2B1O00754 1011 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 LAMTOR5O43504 91 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 ATP2C2O75185 946 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 SLFN14P0C7P3 912 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 PFKFB1P16118 471 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 TNNI1P19237 187 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 CYP2F1P24903 491 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 PCSK1P29120 753 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 LHX1P48742 406 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 CYP24A1Q07973 514 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 PSMD6Q15008 389 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 XXYLT1Q8NBI6 393 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 E2F7Q96AV8 911 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 PAGE5Q96GU1 130 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 SPATA32Q96LK8 384 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 LRRC3BQ96PB8 259 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 FNBP1Q96RU3 617 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 MMS19Q96T76 1030 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 CGRRF1Q99675 332 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 SYT15Q9BQS2 421 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 ACBD6Q9BR61 282 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 TASP1Q9H6P5 420 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 GTF3C4Q9UKN8 822 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 PTPRDP23468 1912 aa9.75□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 MYBPHLA2RUH7 354 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 ARNTLO00327 626 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 CHADO15335 359 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 NCAM2O15394 837 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 KLRC4O43908 158 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 EXOC3O60645 756 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 PDGFRBP09619 1106 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 CCNE1P24864 410 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 LMO2P25791 158 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 CASP4P49662 377 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 NLRP12P59046 1061 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 KRT85P78386 507 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 FCHO2Q0JRZ9 810 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 STK4Q13043 487 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 MTAPQ13126 283 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 FZD5Q13467 585 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 BMT2Q1RMZ1 405 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 TXNDC8Q6A555 127 aa9.74□□□□□ -0.85
MFGE8-213ENST00000560553 TSSK4Q6SA08 328 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms