RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556749.1

TTC7B-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 4

Gene TTC7B, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-210	ENST00000556749	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CDC14C	A4D256	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC35F4	A4IF30	521 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MEN1	O00255	615 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TM4SF5	O14894	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	OGT	O15294	1046 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CHAD	O15335	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	LRP3	O75074	770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	VSIG8	P0DPA2	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	GJA1	P17302	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ATF6	P18850	670 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	PAX3	P23760	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	GDI1	P31150	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ELF1	P32519	619 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MCM4	P33991	863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SOX9	P48436	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CCR3	P51677	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SMTN	P53814	917 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ARPP19	P56211	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	LILRA4	P59901	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	GTF2B	Q00403	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SATB1	Q01826	763 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	LMNB2	Q03252	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SPAG1	Q07617	926 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	DMWD	Q09019	674 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	KYAT1	Q16773	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	FAM3C	Q92520	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	PSMG2	Q969U7	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MSANTD3	Q96H12	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	AK8	Q96MA6	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	STK17A	Q9UEE5	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ASB3	Q9Y575	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749		A0A1W2PRU2	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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