RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	MRS2	Q9HD23	443 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	HCN2	Q9UL51	889 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	MEI4	A8MW99	385 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	N4BP3	O15049	544 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	B3GAT3	O94766	335 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	NPTXR	O95502	500 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	C1S	P09871	688 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC6A11	P48066	632 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	CLCNKB	P51801	687 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	FOSB	P53539	338 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	PDGFRL	Q15198	375 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	SEC23A	Q15436	765 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	AMHR2	Q16671	573 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	DKK3	Q9UBP4	350 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-222	ENST00000555617	ESPL1	Q14674	2120 aa		12.46	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1W2PQF6	199 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	B4GALT5	O43286	388 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	MT-CO3	P00414	261 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	OR4Q2	P0C623	313 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	CCT8	P50990	548 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	PROX2	Q3B8N5	592 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	EOGT	Q5NDL2	527 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	C12orf40	Q86WS4	652 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	GPATCH3	Q96I76	525 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	STAB1	Q9NY15	2570 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	E2F8	A0AVK6	867 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	NDUFS2	O75306	463 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	C8B	P07358	591 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	SFTPC	P11686	197 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	WAS	P42768	502 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	MTF1	Q14872	753 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	NOTUM	Q6P988	496 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	MIB1	Q86YT6	1006 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	BEST2	Q8NFU1	509 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	FOXJ1	Q92949	421 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	MDFI	Q99750	246 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	TBX3	O15119	743 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	RAB11FIP3	O75154	756 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	NCAM1	P13591	858 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	GNLY	P22749	145 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	LSS	P48449	732 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	CYP4F2	P78329	520 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	ST3GAL1	Q11201	340 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	DUSP4	Q13115	394 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	SHB	Q15464	509 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	FHL5	Q5TD97	284 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	USP53	Q70EK8	1073 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	PSMG2	Q969U7	264 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	SGF29	Q96ES7	293 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	TDP1	Q9NUW8	608 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	TACC2	O95359	2948 aa		12.42	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	RTN2	O75298	545 aa		12.42	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	USP12	O75317	370 aa		12.42	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	TH	P07101	528 aa		12.42	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	CDK4	P11802	303 aa		12.42	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	TNFSF9	P41273	254 aa		12.42	□□□□□ -0.42
ABCD4-222	ENST00000555617	DNM2	P50570	870 aa		12.42	□□□□□ -0.42

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