RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554340.1

NEMP1-204, Transcript of nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEMP1, Length 1,381 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1-204ENST00000554340 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 ITGB3P05106 788 aa22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 CASP5P51878 434 aa22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 TSPY1Q01534 308 aa22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 WDR44Q5JSH3 913 aa22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 RAB23Q9ULC3 237 aa22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.03■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 EXTL3O43909 919 aa22.02■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.02■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.02■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.02■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.02■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.02■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.02■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 CFAP45Q9UL16 551 aa22.02■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.02■■□□□ 1.12
NEMP1-204ENST00000554340 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 SDHBP21912 280 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 NLRP12P59046 1061 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 LMNB2Q03252 620 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 TNK2Q07912 1038 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 Q6ZS52 159 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 DHX58Q96C10 678 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 ACBD6Q9BR61 282 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 L1RE1Q9UN81 338 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 TPRP12270 2363 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 EPG5Q9HCE0 2579 aa22.01■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 HUS1O60921 280 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 F11P03951 625 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 TGM1P22735 817 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 ASIC1P78348 528 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 CCINQ13939 588 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 PON2Q15165 354 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 GPD1LQ8N335 351 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 SYNPOQ8N3V7 929 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 CXorf38Q8TB03 319 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 CBWD1Q9BRT8 395 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 ABCB6Q9NP58 842 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 USP18Q9UMW8 372 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 SOBPA7XYQ1 873 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 K7ESF4 209 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 F13A1P00488 732 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 CSH1P0DML2 217 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 CSH2P0DML3 217 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 AVPR1AP37288 418 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 ME1P48163 572 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 FNTBP49356 437 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 ARHGAP8P85298 464 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 MYL7Q01449 175 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 BFSP1Q12934 665 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 SURF1Q15526 300 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 E2F4Q16254 413 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 LPAL2Q16609 132 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 SPATA18Q8TC71 538 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 TRIM9Q9C026 710 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 PARD6AQ9NPB6 346 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 GDAP2Q9NXN4 497 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 ATG2BQ96BY7 2078 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 CNR2P34972 360 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 GPR15P49685 360 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 DMWDQ09019 674 aa21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NEMP1-204ENST00000554340 CNNM4Q6P4Q7 775 aa21.99■■□□□ 1.11
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