RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 SERPINF1P36955 418 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 ASMTP46597 345 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TKTL1P51854 596 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 POLE2P56282 527 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 NLRP5P59047 1200 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 PHC1P78364 1004 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 AMPD2Q01433 879 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 UBE3AQ05086 875 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 EFEMP1Q12805 493 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 MAMLD1Q13495 774 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 PMS2P11Q13670 270 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 ACVR2BQ13705 512 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 DAG1Q14118 895 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 DLGAP5Q15398 846 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TSTQ16762 297 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TIGD6Q17RP2 521 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 DPY19L1Q2PZI1 675 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 WSCD2Q2TBF2 565 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM177Q53S58 311 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC157Q569K6 752 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM47CQ5HY64 1035 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 NT5DC1Q5TFE4 455 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 ACAD10Q6JQN1 1059 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 OLFM4Q6UX06 510 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TMTC3Q6ZXV5 915 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 USP53Q70EK8 1073 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 NUP54Q7Z3B4 507 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 SLFN11Q7Z7L1 901 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 ZER1Q7Z7L7 766 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 MOGAT3Q86VF5 341 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TAX1BP1Q86VP1 789 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 LIX1LQ8IVB5 337 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 NOSTRINQ8IVI9 506 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIM59Q8IWR1 403 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 THNSL1Q8IYQ7 743 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TXLNBQ8N3L3 684 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 LZTR1Q8N653 840 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 ETNPPLQ8TBG4 499 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 PIGOQ8TEQ8 1089 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 EXOC4Q96A65 974 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 ZUFSPQ96AP4 578 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 COA7Q96BR5 231 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 BORCS6Q96GS4 357 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 PEX11GQ96HA9 241 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 FGD4Q96M96 766 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 NOX5Q96PH1 765 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 RHOXF2Q9BQY4 288 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TEX13BQ9BXU2 312 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 C1orf21Q9H246 121 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 BCAS3Q9H6U6 928 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 OBP2BQ9NPH6 170 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 OXSMQ9NWU1 459 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 EXTL2Q9UBQ6 330 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 MORF4L1Q9UBU8 362 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 FBLN5Q9UBX5 448 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 APEX2Q9UBZ4 518 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 C2CD2Q9Y426 696 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TRAF6Q9Y4K3 522 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa3.85□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A0B4J203 849 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 C2orf71A6NGG8 1288 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 LGALS16A8MUM7 142 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 H7C1D1 291 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 NPC1O15118 1278 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 CTAGE5O15320 804 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 PTP4A3O75365 173 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 SEC22BO75396 215 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 DDHD2O94830 711 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 ENDOD1O94919 500 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 AFPP02771 609 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 HEXBP07686 556 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TSPY4P0CV99 314 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TSPY10P0CW01 314 aa3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 HARSP12081 509 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
SYF2P1-201ENST00000550658 MTHFD2P13995 350 aa3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms