RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	CACNA2D1	P54289	1103 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	LOXL3	P58215	753 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	MLC1	Q15049	377 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	FAM136A	Q96C01	138 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	KLC4	Q9NSK0	619 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	CAPN8	A6NHC0	703 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204		A6NNZ2	444 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	TH	P07101	528 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ELFN1	P0C7U0	828 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	KIT	P10721	976 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	PTH2R	P49190	550 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SLC11A2	P49281	568 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	UCP3	P55916	312 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	IQCB1	Q15051	598 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	IL31RA	Q8NI17	732 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	RFK	Q969G6	155 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	FKBP10	Q96AY3	582 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	PBK	Q96KB5	322 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	NELL2	Q99435	816 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ALG8	Q9BVK2	526 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	DPH1	Q9BZG8	443 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	XPR1	Q9UBH6	696 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	L1RE1	Q9UN81	338 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204		A0A087WWL8	130 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	LINC00473	A8K010	186 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ORC4	O43929	436 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	C1QL1	O75973	258 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	LILRA4	P59901	499 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	LAYN	Q6UX15	382 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ANKS1A	Q92625	1134 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	KLK15	Q9H2R5	256 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SERHL	Q9NQF3	203 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	TMX2	Q9Y320	296 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	COX11	Q9Y6N1	276 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	VSTM5	A8MXK1	200 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	MYO1C	O00159	1063 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	MYO1F	O00160	1098 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	BTN3A1	O00481	513 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	TBX3	O15119	743 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	PPM1D	O15297	605 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	FRS3	O43559	492 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	PDHA1	P08559	390 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	CYP2C9	P11712	490 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	PCSK6	P29122	969 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SLC7A1	P30825	629 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	WNT3	P56703	355 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	GBX1	Q14549	363 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	LLGL1	Q15334	1064 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	TBCC	Q15814	346 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ICE2	Q659A1	982 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	APOA5	Q6Q788	366 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	MAVS	Q7Z434	540 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	DTX2	Q86UW9	622 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SLC15A4	Q8N697	577 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		3.79	□□□□□ -1.8

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