RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ARMC6Q6NXE6 501 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 USP51Q70EK9 711 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 DENND1CQ8IV53 801 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 LNX2Q8N448 690 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 RNF31Q96EP0 1072 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 SLC35A4Q96G79 324 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PRRX2Q99811 253 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 BRD9Q9H8M2 597 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 SYNPO2LQ9H987 977 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ARMT1Q9H993 441 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 NMRK2Q9NPI5 230 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 MAN1C1Q9NR34 630 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PHLPP1O60346 1717 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 FAM135BQ49AJ0 1406 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF785A8K8V0 405 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 H3BUI4 141 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PRAMEF10O60809 474 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ERN1O75460 977 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 FOSP01100 380 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 RARBP10826 455 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 HSPA6P17066 643 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ARFIP2P53365 341 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 INHBCP55103 352 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 RAB1AP62820 205 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 DYRK1AQ13627 763 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 FAM167AQ96KS9 214 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 Q96MF0 132 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 SLAMF7Q9NQ25 335 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 KMT5AQ9NQR1 393 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.82□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 FYCO1Q9BQS8 1478 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 JCADQ9P266 1359 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 A0A087X1B8 175 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PPFIA4O75335 1185 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 KIF20AO95235 890 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 GCP02774 474 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ITGAMP11215 1152 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 NPR1P16066 1061 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 HECTD2Q5U5R9 776 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA0895LQ68EN5 471 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TAPT1Q6NXT6 567 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TAF2Q6P1X5 1199 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 USP37Q86T82 979 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ADGRG5Q8IZF4 528 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 COQ10AQ96MF6 247 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TOR3AQ9H497 397 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CFAP97Q9P2B7 532 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 STAP2Q9UGK3 403 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TIAM1Q13009 1591 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC141Q6ZP82 1450 aa4.81□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CEP152O94986 1710 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 MSH6P52701 1360 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 VWC2LB2RUY7 222 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 OVOL3O00110 214 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 DCLK1O15075 740 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ESRRBO95718 433 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PLA2G5P39877 138 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 IL12RB1P42701 662 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CLK3P49761 638 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 HMGA2P52926 109 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 USP14P54578 494 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TAP1Q03518 808 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 NPNTQ6UXI9 565 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 C14orf80Q86SX3 495 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TTC8Q8TAM2 541 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 SSH3Q8TE77 659 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 LPIN2Q92539 896 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM125Q96AQ2 219 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TRIB1Q96RU8 372 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 RSAD1Q9HA92 442 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms