RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521017.5

CCNC-211, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 4

Gene CCNC, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-211ENST00000521017 HARSP12081 509 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 PROZP22891 400 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SLC6A11P48066 632 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 EVCP57679 992 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 NLRP12P59046 1061 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ZXDBP98169 803 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 NR5A1Q13285 461 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CAMK2BQ13554 666 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ECM1Q16610 540 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 C11orf74Q86VG3 221 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 FBXL16Q8N461 479 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ALLCQ8N6M5 410 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TTC16Q8NEE8 873 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 MCPH1Q8NEM0 835 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ACAP3Q96P50 834 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 HAPLN2Q9GZV7 340 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 MMP17Q9ULZ9 603 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 PCDHA12Q9UN75 941 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ARID2Q68CP9 1835 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 OR6C75A6NL08 312 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ARHGAP33O14559 1287 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 MAP3K13O43283 966 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 DEXIO95424 95 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 RPS6KB1P23443 525 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CDC25CP30307 473 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TXKP42681 527 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 MTF1Q14872 753 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 PDGFRLQ15198 375 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ZNF77Q15935 545 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 DUOXA1Q1HG43 343 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 MGAT5BQ3V5L5 792 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ZNF568Q3ZCX4 644 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SLC39A12Q504Y0 691 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ZNF605Q86T29 641 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 IL17RCQ8NAC3 791 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TNFRSF25Q93038 417 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 MTMR9Q96QG7 549 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 DKK4Q9UBT3 224 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SNX14Q9Y5W7 946 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 PCDH15Q96QU1 1955 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 FGF19O95750 216 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 RDXP35241 583 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 AVPR1AP37288 418 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 BFSP1Q12934 665 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 MYBPC2Q14324 1141 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 ZBTB6Q15916 424 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 OVOS1Q6IE37 1185 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 GALNT17Q6IS24 598 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 ITIH5Q86UX2 942 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 MON1AQ86VX9 555 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 NAXDQ8IW45 347 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 DAW1Q8N136 415 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 HMGB4Q8WW32 186 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 ERLEC1Q96DZ1 483 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 PRORYQ9H606 182 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 IL21RQ9HBE5 538 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 CD93Q9NPY3 652 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 TMLHEQ9NVH6 421 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 HCN2Q9UL51 889 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 K7ERI5 159 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 BAG4O95429 457 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 CXCL8P10145 99 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 LRPAP1P30533 357 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 TIE1P35590 1138 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 KRT32Q14532 448 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 CALCRLQ16602 461 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 C12orf40Q86WS4 652 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 CPA6Q8N4T0 437 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNC-211ENST00000521017 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms