RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZWINT	O95229	277 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TTC4	O95801	387 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PRKCG	P05129	697 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PRKCA	P17252	672 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	HCAR3	P49019	387 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NCOA7	Q8NI08	942 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SH3GL1	Q99961	368 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NANOG	Q9H9S0	305 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FSCN2	O14926	492 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC26A4	O43511	780 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	LRRN2	O75325	713 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	STAM2	O75886	525 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ALX3	O95076	343 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DEXI	O95424	95 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	BMP1	P13497	986 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	JUND	P17535	347 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CD247	P20963	164 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PROZ	P22891	400 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NFKBIA	P25963	317 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ETV3	P41162	512 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	STT3A	P46977	705 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF132	P52740	706 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CDKL1	Q00532	357 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GK3P	Q14409	553 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CLUL1	Q15846	466 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	APPBP2	Q92624	585 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM20A	Q96MK3	541 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	VWA7	Q9Y334	891 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159		E5RJQ4	531 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	HAT1	O14929	419 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	KCNQ3	O43525	872 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NAT2	P11245	290 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GLUL	P15104	373 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	XBP1	P17861	261 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FGFR2	P21802	821 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CHKA	P35790	457 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FDFT1	P37268	417 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ENTPD1	P49961	510 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NDST1	P52848	882 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GHRHR	Q02643	423 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PSMD6	Q15008	389 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBE3C	Q15386	1083 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FXN	Q16595	210 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	EFHC2	Q5JST6	749 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65

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