RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514198.1

RHOBTB3-215, Transcript of Rho related BTB domain containing 3, human

TSL 5

Gene RHOBTB3, Length 496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOBTB3-215	ENST00000514198	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	MYO1F	O00160	1098 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	VPS4B	O75351	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	AMPD3	Q01432	767 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	RGMA	Q96B86	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TISP43	B9A030	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	QSOX1	O00391	747 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ZNF213	O14771	459 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PPEF2	O14830	753 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	KIF20A	O95235	890 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ONECUT2	O95948	504 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CHRM3	P20309	590 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PHKA1	P46020	1223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	NOG	Q13253	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	USP37	Q86T82	979 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TNKS	O95271	1327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198		M0QYG6	137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TRIM38	O00635	465 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PPM1D	O15297	605 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TLR5	O60602	858 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CYP2C18	P33260	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	HK3	P52790	923 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ODF1	Q14990	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-215	ENST00000514198		H0YIZ8	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	DNAJB5	O75953	348 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PDC	P20941	246 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	MMP13	P45452	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ICE2	Q659A1	982 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	IGSF3	O75054	1194 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PLCD1	P51178	756 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SATB1	Q01826	763 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	FHL1	Q13642	323 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	USP45	Q70EL2	814 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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