RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CSH1P0DML2 217 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CSH2P0DML3 217 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DLATP10515 647 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PFKFB1P16118 471 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYP2J2P51589 502 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYP24A1Q07973 514 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPR158Q5T848 1215 aa16.24■□□□□ 0.19
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCARA3Q6AZY7 606 aa16.24■□□□□ 0.19
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLDN23Q96B33 292 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM84AQ96KN4 292 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IL21Q9HBE4 155 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EXOC1Q9NV70 894 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.24■□□□□ 0.19
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD72P21854 359 aa16.23■□□□□ 0.19
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 C1orf228Q6PIY5 440 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa16.23■□□□□ 0.19
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 PKMYT1Q99640 499 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CGRRF1Q99675 332 aa16.23■□□□□ 0.19
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 MKNK1Q9BUB5 465 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GTF3C4Q9UKN8 822 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDH9Q9ULB4 789 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRN2O75325 713 aa16.22■□□□□ 0.19
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 AP3M2P53677 418 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STK4Q13043 487 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KMT5BQ4FZB7 885 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STXBP5Q5T5C0 1151 aa16.22■□□□□ 0.19
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PIAS3Q9Y6X2 628 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSC2P49815 1807 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A1W2PQ27 194 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A1W2PQ64 194 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A1W2PQD8 194 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRR23AA6NEV1 266 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARNTLO00327 626 aa16.21■□□□□ 0.19
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 F11P03951 625 aa16.21■□□□□ 0.19
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYP2F1P24903 491 aa16.21■□□□□ 0.19
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 NLRP12P59046 1061 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLCB2Q00722 1185 aa16.21■□□□□ 0.19
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF528Q3MIS6 628 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OSTM1Q86WC4 334 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM3CQ92520 227 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RSPRY1Q96DX4 576 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYRFLQ96LU7 910 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP295NLQ96MC4 621 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYT15Q9BQS2 421 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC46A2Q9BY10 475 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO4Q9UKT5 387 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYBPHLA2RUH7 354 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SHISA7A6NL88 538 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDXKO00764 312 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TACC1O75410 805 aa16.2■□□□□ 0.18
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