RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CLDN23	Q96B33	292 aa		18.54	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	FNBP1	Q96RU3	617 aa		18.54	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM209	Q96SK2	561 aa		18.54	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	IER2	Q9BTL4	223 aa		18.54	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		18.54	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PDXK	O00764	312 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CHAD	O15335	359 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR29	P0C7W0	189 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CSH1	P0DML2	217 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CSH2	P0DML3	217 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ATIC	P31939	592 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEA11	P43364	429 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CLDN10	P78369	228 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ANGPT1	Q15389	498 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	GAREM2	Q75VX8	874 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	HPDL	Q96IR7	371 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PKMYT1	Q99640	499 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	BCO2	Q9BYV7	579 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TASP1	Q9H6P5	420 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	BRD9	Q9H8M2	597 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		18.53	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TACC1	O75410	805 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT19	P08727	400 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ATF6	P18850	670 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ENPEP	Q07075	957 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP24A1	Q07973	514 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	STIM1	Q13586	685 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TEAD2	Q15562	447 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM171B	Q6P995	826 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	VIT	Q6UXI7	678 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MYRFL	Q96LU7	910 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	GCNA	Q96QF7	691 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CGRRF1	Q99675	332 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	DMAC2	Q9NW81	257 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH9	Q9ULB4	789 aa		18.52	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SCN1A	P35498	2009 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PRU2	124 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF263	O14978	683 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPK13	O15264	365 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	TNNI1	P19237	187 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	GABRR2	P28476	465 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCB2	Q00722	1185 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	BFSP1	Q12934	665 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	STK4	Q13043	487 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF12	Q16514	161 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	NFIL3	Q16649	462 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	VSTM1	Q6UX27	236 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	IL21	Q9HBE4	155 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		18.51	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R2	P41236	205 aa		18.5	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		18.5	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		18.5	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	EHD2	Q9NZN4	543 aa		18.5	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM170B	A6NMN3	283 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	ARNTL	O00327	626 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	DPYSL4	O14531	572 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	IKBKB	O14920	756 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	CLIC2	O15247	247 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOC3	O60645	756 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	F11	P03951	625 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	PFKL	P17858	780 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		18.49	■□□□□ 0.55

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