RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484454.1

TARBP1-208, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene TARBP1, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP1-208	ENST00000484454	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	THAP12	O43422	761 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	NDUFA10	O95299	355 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	NR4A1	P22736	598 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	HSPA7	P48741	367 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	TRIM14	Q14142	442 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	MED15	Q96RN5	788 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	CEP72	Q9P209	647 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	ITGA8	P53708	1063 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	WNT3	P56703	355 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	KRT17	Q04695	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	REST	Q13127	1097 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	CDSN	Q15517	529 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	GGT6	Q6P531	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454		A0A087WZ62	844 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454		A0A1W2PS29	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	NDST3	O95803	873 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	C1S	P09871	688 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	CYP2C9	P11712	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	MYL4	P12829	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF20	P17024	532 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	ITGAL	P20701	1170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	ACVR2A	P27037	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	IL1R2	P27930	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	TEC	P42680	631 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	NDUFV1	P49821	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	LOXL3	P58215	753 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	FPGS	Q05932	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARBP1-208	ENST00000484454	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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