RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	LIG4	P49917	911 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	KIF11	P52732	1056 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	JAM2	P57087	298 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	STRN3	Q13033	797 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GPD1L	Q8N335	351 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	SHD	Q96IW2	340 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	WDR24	Q96S15	920 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	MYO6	Q9UM54	1294 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	HES2	Q9Y543	173 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	PATJ	Q8NI35	1801 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364		F8W810	466 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364		K7ERI5	159 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	P4HA2	O15460	535 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	KIF5C	O60282	957 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	EDN1	P05305	212 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	SP9	P0CG40	484 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GCLM	P48507	274 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	HTR4	Q13639	388 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	KIAA1328	Q86T90	577 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	LMO3	Q8TAP4	145 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	TMC2	Q8TDI7	906 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	RMDN1	Q96DB5	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	B3GALT6	Q96L58	329 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	SPAG5	Q96R06	1193 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	DEF6	Q9H4E7	631 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	TFR2	Q9UP52	801 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	RCCD1	A6NED2	376 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PMM2	O15305	246 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	EXTL3	O43909	919 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	AKR1B10	O60218	316 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	TADA2A	O75478	443 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ZMYND10	O75800	440 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	FSHR	P23945	695 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	VAV2	P52735	878 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ENPEP	Q07075	957 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	GRIK3	Q13003	919 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	SPA17	Q15506	151 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC35F6	Q8N357	371 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PJA1	Q8NG27	643 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	RUBCN	Q92622	972 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	AKAP5	P24588	427 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PRKCI	P41743	596 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	STAT1	P42224	750 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	MXI1	P50539	228 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	STARD6	P59095	220 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ARID5A	Q03989	594 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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