RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470258.5

NHLRC3-203, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,298 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-203ENST00000470258 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 PALM2Q8IXS6 379 aa10□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 FAM172AQ8WUF8 416 aa10□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 CNBD2Q96M20 576 aa10□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 C10orf88Q9H8K7 445 aa10□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa10□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 UBR2Q8IWV8 1755 aa10□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ADCY3O60266 1144 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 FDX1P10109 184 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 GZMAP12544 262 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 AQP5P55064 265 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 USH1GQ495M9 461 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 DNAL1Q4LDG9 190 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ANKRD23Q86SG2 305 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 TDRPQ86YL5 185 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 VPS11Q9H270 941 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 TAGLN3Q9UI15 199 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ATP9BO43861 1147 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 FKBP6O75344 327 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 CYP11B1P15538 503 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 RAG1P15918 1043 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 GAP43P17677 238 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 PCSK6P29122 969 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 SLC1A1P43005 524 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 BTDP43251 543 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 RPL5P46777 297 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 SERPINB8P50452 374 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 MXI1P50539 228 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 CCR3P51677 355 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 VAMP7P51809 220 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 SLC18A1P54219 525 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ARHGAP4P98171 946 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 CENPCQ03188 943 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 CCNG2Q16589 344 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 HIF1AQ16665 826 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 LMO3Q8TAP4 145 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 PFDN4Q9NQP4 134 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 SLC24A2Q9UI40 661 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 LZTS1Q9Y250 596 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 LRP5O75197 1615 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 NDC80O14777 642 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 MTA2O94776 668 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 GLRA2P23416 452 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 PHBP35232 272 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 IRX4P78413 519 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 FAM182AQ5T1J6 154 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ZNF180Q9UJW8 692 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 KIF13BQ9NQT8 1826 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 NHSQ6T4R5 1651 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 EML1O00423 815 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 TM9SF1O15321 606 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 TAS2R40P59535 323 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ALCAMQ13740 583 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ITGA9Q13797 1035 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 KLHL35Q6PF15 583 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 C16orf86Q6ZW13 317 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 NLRX1Q86UT6 975 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 SLC51AQ86UW1 340 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 PASD1Q8IV76 773 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 GAB3Q8WWW8 586 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 KREMEN1Q96MU8 473 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-203ENST00000470258 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms