RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 IL17DQ8TAD2 202 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP83Q9Y592 693 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 NCR1O76036 304 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 ELANEP08246 267 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 LAG3P18627 525 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 FGFR2P21802 821 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 ADAM17P78536 824 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 FPGSQ05932 587 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC29A2Q14542 456 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 FANCBQ8NB91 859 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 SNX19Q92543 992 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF31Q96EP0 1072 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 TEX101Q9BY14 249 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 VPS11Q9H270 941 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP72Q9P209 647 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 FNIP2Q9P278 1114 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-205ENST00000462042 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM233B4DJY2 109 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 NCK2O43639 380 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIAP1O43715 76 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM20BO75063 409 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 CDKL5O76039 1030 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 MYL4P12829 197 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 IL1R2P27930 398 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 KRT17Q04695 432 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 RESTQ13127 1097 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP2A13Q16696 494 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 NRN1LQ496H8 165 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 PLA1AQ53H76 456 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 SYNE4Q8N205 404 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 EXTL1Q92935 676 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC78A2IDD5 438 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 DCLK1O15075 740 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 NDUFA10O95299 355 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 IL1R1P14778 569 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 ACVR2AP27037 513 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 PTGS2P35354 604 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 TECP42680 631 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 NPTX2P47972 431 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 NDUFV1P49821 464 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 VAV2P52735 878 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 STK3Q13188 491 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGEF7Q14155 803 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 INTS13Q9NVM9 706 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 FZD1Q9UP38 647 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A0B4J269 797 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 AQP7P3A6NL99 342 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 F5H697 171 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 ADAMTS3O15072 1205 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 IDEP14735 1019 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 CHRM3P20309 590 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCB4P21439 1286 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 PPM1AP35813 382 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 LILRA4P59901 499 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM189BP81408 668 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 TUBB3Q13509 450 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms