RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443353.5

PDK1-208, Transcript of pyruvate dehydrogenase kinase 1, human

TSL 2

Gene PDK1, Length 842 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDK1-208	ENST00000443353	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	STK17A	Q9UEE5	414 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	USP18	Q9UMW8	372 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	MTMR6	Q9Y217	621 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	ANTXRL	A6NF34	631 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	GDF9	O60383	454 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	IL18RAP	O95256	599 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	GCNT3	O95395	438 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	FGF19	O95750	216 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	CDC25C	P30307	473 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	NRL	P54845	237 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	LRRC32	Q14392	662 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	VEPH1	Q14D04	833 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	SV2B	Q7L1I2	683 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	LONP2	Q86WA8	852 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	NME7	Q9Y5B8	376 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	GABRD	O14764	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	ATP2C2	O75185	946 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	EGF	P01133	1207 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	IDE	P14735	1019 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	GAP43	P17677	238 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	LMO2	P25791	158 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	ABCD1	P33897	745 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	ZXDB	P98169	803 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	LMNB2	Q03252	620 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	BFSP1	Q12934	665 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	RUNX3	Q13761	415 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	POSTN	Q15063	836 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	ACBD6	Q9BR61	282 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	TDP1	Q9NUW8	608 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	PANK4	Q9NVE7	773 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDK1-208	ENST00000443353	CEP250	Q9BV73	2442 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	NOL4	O94818	638 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	RET	P07949	1114 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	KRT19	P08727	400 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	GART	P22102	1010 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	PNPLA4	P41247	253 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	GALK1	P51570	392 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	SMARCB1	Q12824	385 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	PPP2R5D	Q14738	602 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	SLC39A14	Q15043	492 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	CCDC6	Q16204	474 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	TAF12	Q16514	161 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	FAM171B	Q6P995	826 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	MON1A	Q86VX9	555 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	PDILT	Q8N807	584 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	ZNF560	Q96MR9	790 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	GCNA	Q96QF7	691 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	ANK1	P16157	1881 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	SCN1A	P35498	2009 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	F5	P12259	2224 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDK1-208	ENST00000443353	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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