RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 GOLGA8IPA6NC78 632 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 OR6C75A6NL08 312 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 GOLGA8JA6NMD2 632 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 GOLGA6L22H0YM25 854 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 K7ESF4 209 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 OGTO15294 1046 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CNR2P34972 360 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ACOT2P49753 483 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 STK4Q13043 487 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 GPR17Q13304 367 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 LPAL2Q16609 132 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SMARCE1Q969G3 411 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 OBP2AQ9NY56 170 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.08■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 HELZP42694 1942 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SDK1Q7Z5N4 2213 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 A0A0B4J269 797 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 MTMR11A4FU01 709 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SLC38A8A6NNN8 435 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CLIC2O15247 247 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 FAM189A1O60320 539 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SMC2O95347 1197 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CLTAP09496 248 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 OR4Q2P0C623 313 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 TYMPP19971 482 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CTHP32929 405 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 DMWDQ09019 674 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 MYBPC2Q14324 1141 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CSRP2Q16527 193 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CAMK4Q16566 473 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 STXBP5Q5T5C0 1151 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ISM2Q6H9L7 571 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SLFN12LQ6IEE8 588 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 TXNDC11Q6PKC3 985 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 PRR23BQ6ZRT6 265 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 Q6ZS52 159 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 LONP2Q86WA8 852 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 PSMG2Q969U7 264 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 TIGD1Q96MW7 591 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 PGLYRP2Q96PD5 576 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 HSFX1Q9UBD0 423 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ASB3Q9Y575 518 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.07■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 HRO43593 1189 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 RHOBTB3O94955 611 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ADRB2P07550 413 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 WEE1P30291 646 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ADSSP30520 456 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 HOXA6P31267 233 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 HOXD13P35453 343 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SOX9P48436 509 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 FNTBP49356 437 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CYP2J2P51589 502 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 EPHB3P54753 998 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 DUSP4Q13115 394 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CCINQ13939 588 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CENPPQ6IPU0 288 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 GAREM2Q75VX8 874 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 YAF2Q8IY57 180 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 KIF12Q96FN5 646 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 LAMA1P25391 3075 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 BIN1O00499 593 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 XPOTO43592 962 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 KRT37O76014 449 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 FGF19O95750 216 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ALDH1A3P47895 512 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 PSMD2Q13200 908 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 KCNB1Q14721 858 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 OVOS1Q6IE37 1185 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CLEC17AQ6ZS10 378 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 USP37Q86T82 979 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms