RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 HSFX1Q9UBD0 423 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SPDYE5A6NIY4 337 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 K7ENM7 598 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TJP3O95049 919 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-DRAP01903 254 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CD48P09326 243 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR2MP0CAP2 368 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SP100P23497 879 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GPD2P43304 727 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK18Q07002 472 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MORF4L2Q15014 288 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SGO2Q562F6 1265 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM130Q8N3G9 435 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 UBL4BQ8N7F7 174 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFAND2BQ8WV99 257 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf70Q9BRQ4 267 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EPB41L1Q9H4G0 881 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ECT2Q9H8V3 914 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GUA9 196 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL33A6NCF5 533 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM64A6NGJ6 449 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM13AO94988 1023 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ASPAP45381 313 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LBRQ14739 615 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NLRP9Q7RTR0 991 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC8Q8TAM2 541 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC44A1Q8WWI5 657 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CPA5Q8WXQ8 436 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GRAMD1AQ96CP6 724 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D22BQ9NU19 505 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPFP49454 3210 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SUN1O94901 812 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SSTR1P30872 391 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT72Q14CN4 511 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 WASHC2DQ5SRD0 308 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 UNC45BQ8IWX7 931 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 C4orf33Q8N1A6 199 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NLGN1Q8N2Q7 840 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 HEMGNQ9BXL5 484 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 BCO2Q9BYV7 579 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 OCEL1Q9H607 264 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PI4K2BG5E9Z4 385 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPN4P29074 926 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 AMHR2Q16671 573 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FNBP1LQ5T0N5 605 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC14AQ86T13 490 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC89Q8N998 374 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 C7orf26Q96N11 449 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TRABDQ9H4I3 376 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SENP1Q9P0U3 644 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPN22Q9Y2R2 807 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 AP1G1O43747 822 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NR3C2P08235 984 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRB3P28472 473 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TAF5Q15542 800 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 P3H1Q32P28 736 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 BRSK2Q8IWQ3 736 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOT1Q8IXI2 618 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CPXM1Q96SM3 734 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SORT1Q99523 831 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PORCNQ9H237 461 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPHQ9H3R5 247 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 C10orf88Q9H8K7 445 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 HAO1Q9UJM8 370 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRFP10586 1907 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 F8W8V4 182 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GAS8O95995 478 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SBK3P0C264 359 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TSHRP16473 764 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRB2P47870 512 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CUL2Q13617 745 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC5A9Q2M3M2 681 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 STYK1Q6J9G0 422 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ILDR2Q71H61 639 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC127Q96BQ5 260 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 C8orf37Q96NL8 207 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GORASP1Q9BQQ3 440 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
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