RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DACH1Q9UI36 760 aa9.17□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.17□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.17□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.17□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa9.17□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.17□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.17□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DENND4CQ5VZ89 1909 aa9.17□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM66O15016 1216 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 P4HA2O15460 535 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PIK3CAP42336 1068 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYL6P60660 151 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CETN1Q12798 172 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PAK1Q13153 545 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HTR4Q13639 388 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TAF12Q16514 161 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM171BQ6P995 826 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MLKLQ8NB16 471 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATAD1Q8NBU5 361 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FBXL13Q8NEE6 735 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLEKHO2Q8TD55 490 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF516Q92618 1163 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FGF13Q92913 245 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PGLYRP2Q96PD5 576 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYADMQ96S97 322 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PKMYT1Q99640 499 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CORO1BQ9BR76 489 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ELOVL4Q9GZR5 314 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLSTN2Q9H4D0 955 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNK12Q9HB15 430 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRPV4Q9HBA0 871 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDH22Q9UJ99 828 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CACNA1HO95180 2353 aa9.16□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ECI2O75521 394 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLSTN1O94985 981 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VNN1O95497 513 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VNN2O95498 520 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MBD3O95983 291 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HLA-DRAP01903 254 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4Q2P0C623 313 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SRFP11831 508 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PFKLP17858 780 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PDE6CP51160 858 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PFKPQ01813 784 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INCA1Q0VD86 236 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTI2Q6NXR4 508 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR6B3Q8NGW1 331 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATA17Q96L03 361 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRRX2Q99811 253 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OBP2AQ9NY56 170 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CEP72Q9P209 647 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COQ4Q9Y3A0 265 aa9.15□□□□□ -0.94
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A8MXQ7 604 aa9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOL4O94818 638 aa9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC192P0DO97 292 aa9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANXA13P27216 316 aa9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP3CCP48454 512 aa9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GCLMP48507 274 aa9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DLG4P78352 724 aa9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WDR44Q5JSH3 913 aa9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1orf220Q5T0J3 134 aa9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCERG1LQ5VWI1 586 aa9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.14□□□□□ -0.95
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms