RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 MPZL3Q6UWV2 235 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 C17orf99Q6UX52 265 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 ERICH1Q86X53 443 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 MTMR12Q9C0I1 747 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa25.08■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 ACKR2O00590 384 aa25.08■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 MED7O43513 233 aa25.08■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 CA12O43570 354 aa25.08■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 SNX3O60493 162 aa25.08■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 IL18RAPO95256 599 aa25.08■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 HOXC6P09630 235 aa25.08■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 MFSD7Q6UXD7 560 aa25.08■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa25.08■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa25.08■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 FZD8Q9H461 694 aa25.08■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 WDR35Q9P2L0 1181 aa25.08■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 TNNC2P02585 160 aa25.07■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 VCPP55072 806 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 OASLQ15646 514 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 P3H1Q32P28 736 aa25.07■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa25.07■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 DYDC1Q8WWB3 177 aa25.07■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 GPR20Q99678 358 aa25.07■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 XYLT2Q9H1B5 865 aa25.07■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 RNF186Q9NXI6 227 aa25.07■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 SHOC2Q9UQ13 582 aa25.07■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.07■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 PCGF5Q86SE9 256 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 WDTC1Q8N5D0 677 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 TTC13Q8NBP0 860 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 SGSM3Q96HU1 749 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 MCEEQ96PE7 176 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 NFKBIZQ9BYH8 718 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 PCDH9Q9HC56 1237 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 SLC40A1Q9NP59 571 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 ZNF148Q9UQR1 794 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 SIGLEC16A6NMB1 481 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 HARSP12081 509 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 BRAFP15056 766 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 CDKN2BP42772 138 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 POU5F1BQ06416 359 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 ZNF699Q32M78 642 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 CCDC38Q502W7 563 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 KLC4Q9NSK0 619 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 SENP1Q9P0U3 644 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 DNPEPQ9ULA0 475 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 SLC12A4Q9UP95 1085 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 TTLL13PA6NNM8 815 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB42B2RXF5 422 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 SMAPO00193 183 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 TRPA1O75762 1119 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 KRT7P08729 469 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 WEE2P0C1S8 567 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 BRD2P25440 801 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 ASPAP45381 313 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 CAP1Q01518 475 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 ACAP1Q15027 740 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 TAZQ16635 292 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 SEZ6Q53EL9 994 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB33Q86T24 672 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 RNF149Q8NC42 400 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.05■■□□□ 1.6
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PMS1-205ENST00000409985 SLC35B2Q8TB61 432 aa25.04■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 MAML1Q92585 1016 aa25.04■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 MAGEB18Q96M61 343 aa25.04■■□□□ 1.6
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PMS1-205ENST00000409985 ALOX15BO15296 676 aa25.04■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 VPS41P49754 854 aa25.04■■□□□ 1.6
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PMS1-205ENST00000409985 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.04■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa25.04■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 TNFSF13BQ9Y275 285 aa25.04■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25.04■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 SUN1O94901 812 aa25.03■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 KRT10P13645 584 aa25.03■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 CTGFP29279 349 aa25.03■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 RDXP35241 583 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 ARSEP51690 589 aa25.03■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa25.03■■□□□ 1.6
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