RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 PP2D1A8MPX8 630 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 NBR1Q14596 966 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD1Q15327 319 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf74Q86VG3 221 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 RASSF3Q86WH2 238 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 CPA6Q8N4T0 437 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 EXOC4Q96A65 974 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 GPR15P49685 360 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 PDIA5Q14554 519 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 MTF1Q14872 753 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 ANO7Q6IWH7 933 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 MON1AQ86VX9 555 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 SLC32A1Q9H598 525 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 MYH11P35749 1972 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 FAM189A1O60320 539 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 ADRB2P07550 413 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 PLS3P13797 630 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 GUCY2CP25092 1073 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 CDC25AP30304 524 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 MAPK8P45983 427 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM61Q5EBN2 209 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 JADE1Q6IE81 842 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 TTC16Q8NEE8 873 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 USP33Q8TEY7 942 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 FAM212AQ96EL1 285 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 PTPRDP23468 1912 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTS20P59510 1910 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 SCN1AP35498 2009 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 PIRO00625 290 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 SMTNP53814 917 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 SEC13P55735 322 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 ST3GAL1Q11201 340 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf27AQ580R0 203 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 BICD1Q96G01 975 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM74BQ9NUR3 256 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 STK24Q9Y6E0 443 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 ANO9A1A5B4 782 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 K7EQS6 105 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 CYB561D2O14569 222 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 TADA3O75528 432 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 CAPNS1P04632 268 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 ENGP17813 658 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 PAX3P23760 479 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 IFNAR2P48551 515 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 LMAN2Q12907 356 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF77Q15935 545 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 EML3Q32P44 896 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 PIP4P1Q86T03 277 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 TTC30AQ86WT1 665 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 METTL23Q86XA0 190 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 RLN3Q8WXF3 142 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A12Q96S37 553 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 TIPINQ9BVW5 301 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HOXD12-201ENST00000404162 PCNX2A6NKB5 2137 aa20.83■□□□□ 0.92
HOXD12-201ENST00000404162 OGTO15294 1046 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD12-201ENST00000404162 NFICP08651 508 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
HOXD12-201ENST00000404162 SMARCB1Q12824 385 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD12-201ENST00000404162 KRT79Q5XKE5 535 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD12-201ENST00000404162 WSCD1Q658N2 575 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD12-201ENST00000404162 C19orf48Q6RUI8 117 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD12-201ENST00000404162 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD12-201ENST00000404162 FRMD1Q8N878 549 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD12-201ENST00000404162 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD12-201ENST00000404162 ATP2A3Q93084 1043 aa20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms