RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399207.5

SETD4-204, Transcript of SET domain containing 4, human

TSL 3 BASIC

Gene SETD4, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SETD4-204	ENST00000399207	GSDMA	Q96QA5	445 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	GCNA	Q96QF7	691 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	KXD1	Q9BQD3	176 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	SNX25	Q9H3E2	840 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	ABCB6	Q9NP58	842 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	MAPK13	O15264	365 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	KRT13	P13646	458 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	NR2F2	P24468	414 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	CDR1	P51861	262 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	GPC5	P78333	572 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	CLDN10	P78369	228 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	PNOC	Q13519	176 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	NFIL3	Q16649	462 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	GPR152	Q8TDT2	470 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	ZNF516	Q92618	1163 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	SMARCD2	Q92925	531 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	E2F7	Q96AV8	911 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	TIGD1	Q96MW7	591 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	CDH9	Q9ULB4	789 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	CA14	Q9ULX7	337 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207		A0A1W2PRU2	124 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	IKBKB	O14920	756 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	TACC1	O75410	805 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	CSH1	P0DML2	217 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	CSH2	P0DML3	217 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	P4HA1	P13674	534 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	GJA1	P17302	382 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	GABRR2	P28476	465 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	CDC25C	P30307	473 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	PLA2G5	P39877	138 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	CASP4	P49662	377 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	MYL6	P60660	151 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	ADAM9	Q13443	819 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	NCOA4	Q13772	614 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	TEAD2	Q15562	447 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	ZNF699	Q32M78	642 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	TMC8	Q8IU68	726 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	GIPC2	Q8TF65	315 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	SMARCE1	Q969G3	411 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	ASB16	Q96NS5	453 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	SYT15	Q9BQS2	421 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	LRRC3	Q9BY71	257 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SETD4-204	ENST00000399207	KRBA1	A5PL33	1030 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	DPYSL4	O14531	572 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	MOSPD3	O75425	235 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	ATF6	P18850	670 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	CYP2F1	P24903	491 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	LMO2	P25791	158 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	VAMP7	P51809	220 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	PTPN5	P54829	565 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	STIM1	Q13586	685 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SETD4-204	ENST00000399207	FAM171B	Q6P995	826 aa		11.7	□□□□□ -0.54

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