RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393324.7

ME3-202, Transcript of malic enzyme 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ME3, Length 2,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3-202ENST00000393324 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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ME3-202ENST00000393324 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.43■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 FAM153AQ9UHL3 310 aa21.43■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.43■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.43■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 PIRO00625 290 aa21.43■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 FSCN2O14926 492 aa21.43■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 CHRNA1P02708 482 aa21.43■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 NNTQ13423 1086 aa21.43■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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ME3-202ENST00000393324 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.43■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 C12orf29Q8N999 325 aa21.43■■□□□ 1.02
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ME3-202ENST00000393324 PDCLQ13371 301 aa21.42■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.42■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 TRIM51Q9BSJ1 452 aa21.42■■□□□ 1.02
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ME3-202ENST00000393324 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.42■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.41■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 F8VP50 259 aa21.41■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 DAPK3O43293 454 aa21.41■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 ERBB2P04626 1255 aa21.41■■□□□ 1.02
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ME3-202ENST00000393324 CYP1B1Q16678 543 aa21.41■■□□□ 1.02
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ME3-202ENST00000393324 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 XYLT1Q86Y38 959 aa21.41■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 KATNAL2Q8IYT4 538 aa21.41■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 56.2
ME3-202ENST00000393324 SEC14L1Q92503 715 aa21.41■■□□□ 1.02
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ME3-202ENST00000393324 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa21.41■■□□□ 1.02
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ME3-202ENST00000393324 ECHS1P30084 290 aa21.41■■□□□ 1.02
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ME3-202ENST00000393324 SRRDQ9UH36 339 aa21.41■■□□□ 1.02
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ME3-202ENST00000393324 TCF4P15884 667 aa21.4■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 CAPN2P17655 700 aa21.4■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 PNPLA4P41247 253 aa21.4■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 GABRB2P47870 512 aa21.4■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 STILQ15468 1287 aa21.4■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 PTGISQ16647 500 aa21.4■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.4■■□□□ 1.02
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ME3-202ENST00000393324 EXD1Q8NHP7 514 aa21.4■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 JOSD2Q8TAC2 188 aa21.4■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.4■■□□□ 1.02
ME3-202ENST00000393324 ERP44Q9BS26 406 aa21.4■■□□□ 1.02
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ME3-202ENST00000393324 DPH5Q9H2P9 285 aa21.4■■□□□ 1.02
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ME3-202ENST00000393324 RALAP11233 206 aa21.39■■□□□ 1.01
ME3-202ENST00000393324 HOXD10P28358 340 aa21.39■■□□□ 1.01
ME3-202ENST00000393324 TAF6P49848 677 aa21.39■■□□□ 1.01
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