RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 GABRR2P28476 465 aa22.05■■□□□ 1.12
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UBE2E3-201ENST00000392415 PNOCQ13519 176 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.05■■□□□ 1.12
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UBE2E3-201ENST00000392415 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.05■■□□□ 1.12
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UBE2E3-201ENST00000392415 GIPC2Q8TF65 315 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 IL21Q9HBE4 155 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 CDH9Q9ULB4 789 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 PI15O43692 258 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 PHACTR2O75167 634 aa22.04■■□□□ 1.12
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UBE2E3-201ENST00000392415 TCF15Q12870 199 aa22.04■■□□□ 1.12
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UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC142Q17RM4 750 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP135Q66GS9 1140 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.127e-14■□□□□ 11.3
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UBE2E3-201ENST00000392415 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D17Q9HA65 648 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 IKBKBO14920 756 aa22.03■■□□□ 1.12
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UBE2E3-201ENST00000392415 NR2F2P24468 414 aa22.03■■□□□ 1.12
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UBE2E3-201ENST00000392415 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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UBE2E3-201ENST00000392415 STK25O00506 426 aa22.02■■□□□ 1.12
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UBE2E3-201ENST00000392415 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.02■■□□□ 1.12
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UBE2E3-201ENST00000392415 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.02■■□□□ 1.12
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UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA20Q8TB22 786 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 E2F7Q96AV8 911 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 NME7Q9Y5B8 376 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2E3-201ENST00000392415 PIEZO1Q92508 2521 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPRDP23468 1912 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 MYO15AQ9UKN7 3530 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 AKAP3O75969 853 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 VNN1O95497 513 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 CSH1P0DML2 217 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 CSH2P0DML3 217 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 MAGEA11P43364 429 aa22.01■■□□□ 1.11
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UBE2E3-201ENST00000392415 DDR2Q16832 855 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 ZACNQ401N2 412 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR158Q5T848 1215 aa22.01■■□□□ 1.11
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UBE2E3-201ENST00000392415 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 SNX25Q9H3E2 840 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 F11P03951 625 aa22■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 RFX1P22670 979 aa22■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 WEE1P30291 646 aa22■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
UBE2E3-201ENST00000392415 VAMP7P51809 220 aa22■■□□□ 1.11
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