RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390664.2

CHST6-202, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHST6, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST6-202ENST00000390664 PDCLQ13371 301 aa24.12■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 BRD3Q15059 726 aa24.12■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa24.12■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 DCUN1D2Q6PH85 259 aa24.12■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 UBA3Q8TBC4 463 aa24.12■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 SNX25Q9H3E2 840 aa24.12■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 TJP2Q9UDY2 1190 aa24.12■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 FGFR1P11362 822 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 VSNL1P62760 191 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 WDR93Q6P2C0 686 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 ADGRF2Q8IZF7 708 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 DPEP3Q9H4B8 488 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 CACNG4Q9UBN1 327 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 IP6K2Q9UHH9 426 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 TMEM191CA6NGB0 347 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 KRIT1O00522 736 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 RWDD2BP57060 319 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 MBTPS1Q14703 1052 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 CLUL1Q15846 466 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 SEL1L2Q5TEA6 688 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 DEFB118Q96PH6 123 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 WDR35Q9P2L0 1181 aa24.11■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 HCRTO43612 131 aa24.1■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 ERBB2P04626 1255 aa24.1■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 MCM3P25205 808 aa24.1■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 CLCNKBP51801 687 aa24.1■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 MTFR1Q15390 333 aa24.1■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 LONRF2Q1L5Z9 754 aa24.1■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 TMCO3Q6UWJ1 677 aa24.1■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 KRT12Q99456 494 aa24.1■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 DNAI2Q9GZS0 605 aa24.1■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 UBN1Q9NPG3 1134 aa24.1■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.1■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 CCDC188H7C350 402 aa24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 PODXLO00592 558 aa24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 PDGFRBP09619 1106 aa24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 MAN1A1P33908 653 aa24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 CYB561D2O14569 222 aa24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 LMO2P25791 158 aa24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 GABRB2P47870 512 aa24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 CDK7P50613 346 aa24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 AADACL2Q6P093 401 aa24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 XYLT1Q86Y38 959 aa24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 ECHDC2Q86YB7 292 aa24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 ST7Q9NRC1 585 aa24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 HESX1Q9UBX0 185 aa24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 PYGMP11217 842 aa24.08■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 WARSP23381 471 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa24.08■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 ARHGAP17Q68EM7 881 aa24.08■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 KLHL7Q8IXQ5 586 aa24.08■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.08■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 CRYBG2Q8N1P7 616 aa24.08■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 USTQ9Y2C2 406 aa24.08■■□□□ 1.45
CHST6-202ENST00000390664 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 ERLIN1O75477 346 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 POMCP01189 267 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 PFKMP08237 780 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 KRT3P12035 628 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 TTC30AQ86WT1 665 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 PLVAPQ9BX97 442 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 RGS18Q9NS28 235 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 RPL9P32969 192 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 GRIK3Q13003 919 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 PKDCCQ504Y2 493 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 TNIP3Q96KP6 325 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 LPIN3Q9BQK8 851 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 RNF208Q9H0X6 261 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa24.07■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 PSTPIP1O43586 416 aa24.06■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 ZMYND10O75800 440 aa24.06■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 CCL5P13501 91 aa24.06■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 SELPP16109 830 aa24.06■■□□□ 1.44
CHST6-202ENST00000390664 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms