RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 TOP6BLQ8N6T0 577 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 HPDLQ96IR7 371 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 PI4K2AQ9BTU6 479 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 IL21Q9HBE4 155 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 SHISA7A6NL88 538 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 FAM170BA6NMN3 283 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 RHOBTB3O94955 611 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 FGF19O95750 216 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 CYP24A1Q07973 514 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 STK4Q13043 487 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 PSMD6Q15008 389 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 GPR158Q5T848 1215 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 FRMD5Q7Z6J6 570 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 ADGRF2Q8IZF7 708 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 PKMYT1Q99640 499 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 GABRDO14764 452 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 GFRA3O60609 400 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 TARSP26639 723 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 GPR15P49685 360 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 CYP4F8P98187 520 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 DPYDQ12882 1025 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 MYO1EQ12965 1108 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 KCNB1Q14721 858 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC142Q17RM4 750 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 LIMS2Q7Z4I7 341 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 SLC9A9Q8IVB4 645 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 SPATA18Q8TC71 538 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 IRF7Q92985 503 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC127Q96BQ5 260 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 CGRRF1Q99675 332 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 OSBPL6Q9BZF3 934 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 GTF3C4Q9UKN8 822 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 OBSL1O75147 1896 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 CST3P01034 146 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 TNNI1P19237 187 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 LHX1P48742 406 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 TAF12Q16514 161 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 DPH6Q7L8W6 267 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 STKLD1Q8NE28 680 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 E2F7Q96AV8 911 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 FNBP1Q96RU3 617 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 F5P12259 2224 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 PATJQ8NI35 1801 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-201ENST00000378543 PDXKO00764 312 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF263O14978 683 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 CYP2F1P24903 491 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 CDC25CP30307 473 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 SDHAF4Q5VUM1 108 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF852Q6ZMS4 543 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 ASCL5Q7RTU5 278 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 C1orf210Q8IVY1 113 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF516Q92618 1163 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 LRRC3BQ96PB8 259 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 BCO2Q9BYV7 579 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 TASP1Q9H6P5 420 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 TRPV5Q9NQA5 729 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 MYBPHLA2RUH7 354 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 PCSK1P29120 753 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 DDR2Q16832 855 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 TIGD1Q96MW7 591 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 NELL2Q99435 816 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 ARNTLO00327 626 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 EXOC3O60645 756 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 ATP2C2O75185 946 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 F11P03951 625 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 LMO2P25791 158 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM150AQ86TG1 271 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 YAF2Q8IY57 180 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 GCNAQ96QF7 691 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 SLC46A2Q9BY10 475 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 ABCB6Q9NP58 842 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 DMAC2Q9NW81 257 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 RMND1Q9NWS8 449 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 USP34Q70CQ2 3546 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 PRR23AA6NEV1 266 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 PRAMEF12O95522 483 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-201ENST00000378543 CSH1P0DML2 217 aa25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms