RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 FZD5Q13467 585 aa24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 VEPH1Q14D04 833 aa24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 DUOXA2Q1HG44 320 aa24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 MFSD6LQ8IWD5 586 aa24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPATA32Q96LK8 384 aa24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACBD6Q9BR61 282 aa24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPR88Q9GZN0 384 aa24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 HPSEQ9Y251 543 aa24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 R4GN57 208 aa24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 F5P12259 2224 aa24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 GABRDO14764 452 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 CST3P01034 146 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 CYP2F1P24903 491 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 STK4Q13043 487 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 PSMD6Q15008 389 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 DDR2Q16832 855 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 C1orf210Q8IVY1 113 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF687Q8N1G0 1237 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 XXYLT1Q8NBI6 393 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF516Q92618 1163 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZFYVE19Q96K21 471 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 CGRRF1Q99675 332 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIAA1586Q9HCI6 787 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 NME7Q9Y5B8 376 aa24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF25-201ENST00000348333 MYBPHLA2RUH7 354 aa24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRR29P0C7W0 189 aa24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 LMO2P25791 158 aa24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 CASP4P49662 377 aa24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 MYL7Q01449 175 aa24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 SMARCB1Q12824 385 aa24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 SURF1Q15526 300 aa24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 IRF7Q92985 503 aa24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 HELZP42694 1942 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF263O14978 683 aa24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 SP9P0CG40 484 aa24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 TNNI1P19237 187 aa24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 CMA1P23946 247 aa24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 SOX9P48436 509 aa24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 KRT85P78386 507 aa24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF852Q6ZMS4 543 aa24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC46A2Q9BY10 475 aa24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 BCO2Q9BYV7 579 aa24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 OSBPL6Q9BZF3 934 aa24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 TASP1Q9H6P5 420 aa24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIAS3Q9Y6X2 628 aa24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 F11P03951 625 aa24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 NDUFA8P51970 172 aa24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 NLRP12P59046 1061 aa24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 FCHO2Q0JRZ9 810 aa24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 MYO1EQ12965 1108 aa24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 TTC8Q8TAM2 541 aa24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLDN23Q96B33 292 aa24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 ELMO3Q96BJ8 720 aa24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 CRTAC1Q9NQ79 661 aa24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 CFAP54Q96N23 3096 aa24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC38A8A6NNN8 435 aa24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 TADA3O75528 432 aa24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 FGF19O95750 216 aa24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDC25CP30307 473 aa24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 LHX1P48742 406 aa24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 TAF12Q16514 161 aa24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 FNBP1Q96RU3 617 aa24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYT15Q9BQS2 421 aa24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRPV5Q9NQA5 729 aa24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 EXOC1Q9NV70 894 aa24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 EXOC3O60645 756 aa24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDGFRBP09619 1106 aa24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 WDR44Q5JSH3 913 aa24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM171BQ6P995 826 aa24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 YAF2Q8IY57 180 aa24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 RIN3Q8TB24 985 aa24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPATA18Q8TC71 538 aa24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 MYLPFQ96A32 169 aa24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 E2F7Q96AV8 911 aa24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 GCNAQ96QF7 691 aa24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF25-201ENST00000348333 MMS19Q96T76 1030 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms