RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
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NISCH-201ENST00000345716 TGFB3P10600 412 aa21.65■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 OAZ1P54368 228 aa21.65■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.062e-10■□□□□ 10.2
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NISCH-201ENST00000345716 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.65■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 C4orf22Q6V702 233 aa21.65■■□□□ 1.06
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NISCH-201ENST00000345716 ADA2Q9NZK5 511 aa21.65■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.65■■□□□ 1.06
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NISCH-201ENST00000345716 MRC1P22897 1456 aa21.65■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.065e-11■■■□□ 15.2
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NISCH-201ENST00000345716 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.64■■□□□ 1.06
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NISCH-201ENST00000345716 CCDC138Q96M89 665 aa21.64■■□□□ 1.05
NISCH-201ENST00000345716 CXCL8P10145 99 aa21.63■■□□□ 1.05
NISCH-201ENST00000345716 AP2B1P63010 937 aa21.63■■□□□ 1.05
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NISCH-201ENST00000345716 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
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NISCH-201ENST00000345716 USP20Q9Y2K6 914 aa21.63■■□□□ 1.05
NISCH-201ENST00000345716 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.63■■□□□ 1.05
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NISCH-201ENST00000345716 OPTNQ96CV9 577 aa21.63■■□□□ 1.05
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NISCH-201ENST00000345716 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa21.62■■□□□ 1.05
NISCH-201ENST00000345716 EMC1Q8N766 993 aa21.62■■□□□ 1.05
NISCH-201ENST00000345716 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.62■■□□□ 1.05
NISCH-201ENST00000345716 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
NISCH-201ENST00000345716 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
NISCH-201ENST00000345716 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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