RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 CCDC188H7C350 402 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 ERLIN1O75477 346 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 ZMYND10O75800 440 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 PYGMP11217 842 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 TAP1Q03518 808 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 AADACL2Q6P093 401 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 KLHL7Q8IXQ5 586 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 MCEEQ96PE7 176 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SYNCQ9H7C4 482 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 MIOSQ9NXC5 875 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 IP6K2Q9UHH9 426 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 ARVCFO00192 962 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 HUS1O60921 280 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SLC7A5Q01650 507 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 PDCLQ13371 301 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 L1RE1Q9UN81 338 aa20.29■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 FGFR1P11362 822 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 RNF169Q8NCN4 708 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SNX25Q9H3E2 840 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 STIM2Q9P246 746 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.28■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 ERBB2P04626 1255 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 PDGFRBP09619 1106 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 MAN1A1P33908 653 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 GABRB2P47870 512 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SCNN1GP51170 649 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 RUBCNQ92622 972 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 HINFPQ9BQA5 517 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA8SH3BPF8 625 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 KRT3P12035 628 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SKIP12755 728 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 LMO2P25791 158 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 GSCP56915 257 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 XYLT1Q86Y38 959 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 PGBD4Q96DM1 585 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 RSAD1Q9HA92 442 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 USTQ9Y2C2 406 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 NR2E1Q9Y466 385 aa20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 HCRTO43612 131 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 PFKMP08237 780 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 CLCNKBP51801 687 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 PLVAPQ9BX97 442 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 ST7Q9NRC1 585 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 CYB561D2O14569 222 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 PSTPIP1O43586 416 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 OGDHQ02218 1023 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 MBTPS1Q14703 1052 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 PKDCCQ504Y2 493 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 UBN1Q9NPG3 1134 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 HESX1Q9UBX0 185 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 DNM1LO00429 736 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 PODXLO00592 558 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 RAD51CO43502 376 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 GLI1P08151 1106 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 FAM163BP0C2L3 166 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-201ENST00000331803 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms