RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 KIAA0319Q5VV43 1072 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 KIAA1328Q86T90 577 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 TMEM169Q96HH4 297 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 TAS2R14Q9NYV8 317 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 SPG21Q9NZD8 308 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 RTN2O75298 545 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 LCLAT1Q6UWP7 414 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 DNAAF5Q86Y56 855 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 TSPAN16Q9UKR8 245 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 CEP83Q9Y592 693 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 FAM170AA1A519 330 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 CCP110O43303 1012 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 MICAL2O94851 1124 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 UNGP13051 313 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 VAV2P52735 878 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 B3GALT6Q96L58 329 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 ISCUQ9H1K1 167 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 KCND1Q9NSA2 647 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 USP27XA6NNY8 438 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 EFEMP2O95967 443 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 FTLP02792 175 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 PPM1AP35813 382 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 NOMO3P69849 1222 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 NAA35Q5VZE5 725 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 ACAD10Q6JQN1 1059 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 DENND1BQ6P3S1 775 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 TMEM35BQ8NCS4 154 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 CPA5Q8WXQ8 436 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 TTPALQ9BTX7 342 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 LHX5Q9H2C1 402 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 CRTAC1Q9NQ79 661 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 TFR2Q9UP52 801 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 A0A0U1RQJ8 604 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 MYBPHLA2RUH7 354 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 LCHNA4D1U4 455 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 ESPNB1AK53 854 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 M0QYV0 167 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 LSM8O95777 96 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 H2AFZP0C0S5 128 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 CCDC130P13994 396 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 RABGGTBP53611 331 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 TSPY1Q01534 308 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 USP41Q3LFD5 358 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 H2AFVQ71UI9 128 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 REXO1L1PQ8IX06 675 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 PACSIN1Q9BY11 444 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 HESX1Q9UBX0 185 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 GTF3C4Q9UKN8 822 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 PTPRDP23468 1912 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 LINC00271P0C7V0 271 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 NSFP46459 744 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 CENPCQ03188 943 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 CCDC142Q17RM4 750 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 RTP2Q5QGT7 225 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 UBA3Q8TBC4 463 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 SLC2A14Q8TDB8 520 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 TMEM209Q96SK2 561 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 GDF15Q99988 308 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 RCCD1A6NED2 376 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 SOD2P04179 222 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 ADORA2BP29275 332 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 GALCP54803 685 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 KIF5AQ12840 1032 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 CTXN3Q4LDR2 81 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 ZNF280DQ6N043 979 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 FAM171BQ6P995 826 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 FUKQ8N0W3 1084 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 PCED1BQ96HM7 432 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 LACRTQ9GZZ8 138 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 INTUQ9ULD6 942 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.46■■□□□ 1.35
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