RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292393.9

ZNF3-201, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF3, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-201ENST00000292393 FGFR3P22607 806 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 MMP8P22894 467 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 GALCP54803 685 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 PLCB3Q01970 1234 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 ORC1Q13415 861 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 PKDCCQ504Y2 493 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 FUT10Q6P4F1 479 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 C12orf29Q8N999 325 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 HASPINQ8TF76 798 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 STK32AQ8WU08 396 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 ZNF558Q96NG5 402 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 YME1L1Q96TA2 773 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 RTP3Q9BQQ7 232 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 SYT15Q9BQS2 421 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 DPEP3Q9H4B8 488 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 LZTFL1Q9NQ48 299 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 TAS2R14Q9NYV8 317 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 HESX1Q9UBX0 185 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 GTF3C4Q9UKN8 822 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 TSPAN16Q9UKR8 245 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 TSC2P49815 1807 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 NCANO14594 1321 aa12.85□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 CCDC85CA6NKD9 419 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 TMCO5BA8MYB1 307 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 I3L4J1 428 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 CYP1A2P05177 515 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 CALB1P05937 261 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 CFHP08603 1231 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 PPM1AP35813 382 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 GPD2P43304 727 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 BCAT1P54687 386 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 HADHBP55084 474 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 GSCP56915 257 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 GPC5P78333 572 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 PTPN14Q15678 1187 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 NAA35Q5VZE5 725 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 DENND1BQ6P3S1 775 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 FAM171BQ6P995 826 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 KCNT2Q6UVM3 1135 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 MON1BQ7L1V2 547 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 HERC6Q8IVU3 1022 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 RHOT2Q8IXI1 618 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 GPR65Q8IYL9 337 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 MCOLN2Q8IZK6 566 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 SLC39A11Q8N1S5 342 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 WDTC1Q8N5D0 677 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 ANKRD52Q8NB46 1076 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 MSANTD4Q8NCY6 345 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 RFFLQ8WZ73 363 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 IGSF21Q96ID5 467 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 NOX5Q96PH1 765 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 RAD9AQ99638 391 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 PKMYT1Q99640 499 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 PACSIN1Q9BY11 444 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 MIS12Q9H081 205 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 CRTAC1Q9NQ79 661 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 CYLDQ9NQC7 956 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 AAASQ9NRG9 546 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 HCSTQ9UBK5 93 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 STRIP2Q9ULQ0 834 aa12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
ZNF3-201ENST00000292393 A0A0U1RQJ8 604 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 OR6C75A6NL08 312 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 H7C4K7 107 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 M0QYV0 167 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 HCRTO43612 131 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 KIF5CO60282 957 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 MTA2O94776 668 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 TKTP29401 623 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 GABRB2P47870 512 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 SNX16P57768 344 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 TSPY1Q01534 308 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 BST2Q10589 180 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 PTP4A2Q12974 167 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 FAM171A1Q5VUB5 890 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 KIAA0319Q5VV43 1072 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 ZNF280DQ6N043 979 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 ANKS3Q6ZW76 656 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 PASD1Q8IV76 773 aa12.83□□□□□ -0.36
ZNF3-201ENST00000292393 FUKQ8N0W3 1084 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms