RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 MED24O75448 989 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 KIZQ2M2Z5 673 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 IPMKQ8NFU5 416 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 FOPNLQ96NB1 174 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 E9PCH4 1651 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 TADA2AO75478 443 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB7AO95365 584 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 TRPC1P48995 793 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 STX19Q8N4C7 294 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEB18Q96M61 343 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 LOC100653049A0A140TA62 436 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 IQCA1LA6NCM1 817 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 KRT34O76011 436 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CXorf56Q9H5V9 222 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF229Q9UJW7 825 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SLC39A10Q9ULF5 831 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA9O76027 345 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ITGA4P13612 1032 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 STX5Q13190 355 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA17Q96L03 361 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 GLRA3O75311 464 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 DAB1O75553 588 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA13P48723 471 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK10P57789 538 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC71Q8N4P6 559 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 LACRTQ9GZZ8 138 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 OGTO15294 1046 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SGPL1O95470 568 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ICAM1P05362 532 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 HERVK_113P62684 666 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 FAM83EQ2M2I3 478 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 IL31Q6EBC2 164 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ANKS3Q6ZW76 656 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 PKP3Q9Y446 797 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf58C9J3I9 102 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SREBF1P36956 1147 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 FAM111AQ96PZ2 611 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 NAT9Q9BTE0 207 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CD274Q9NZQ7 290 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SUPT3HB4E1H0 165 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CYP11B1P15538 503 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 GARTP22102 1010 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ATICP31939 592 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 MCL1Q07820 350 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 MTM1Q13496 603 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D19Q8N5T2 526 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 GIT2Q14161 759 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 PCSK7Q16549 785 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 NOTUMQ6P988 496 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D23Q9NUY8 699 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF711Q9Y462 761 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 O00370 1275 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 MYBPC2Q14324 1141 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SYTL3Q4VX76 610 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 WLSQ5T9L3 541 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ADCK1Q86TW2 530 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CYGBQ8WWM9 190 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 PIDD1Q9HB75 910 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 FAM200BP0CF97 657 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 TFDP3Q5H9I0 405 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 NLRP9Q7RTR0 991 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 TMC2Q8TDI7 906 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 TAF6P49848 677 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT4Q8N4A0 578 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2C9P11712 490 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 RANBP1P43487 201 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 PDK2Q15119 407 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms