RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 PARVGQ9HBI0 331 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 K7ENM7 598 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 LSM1O15116 133 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 STRNO43815 780 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TRMUO75648 421 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TCEA3O75764 348 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 KRT1P04264 644 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PDE1BQ01064 536 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ATP1A4Q13733 1029 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ALCAMQ13740 583 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 LPIN1Q14693 890 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ADGRF4Q8IZF3 695 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ETNPPLQ8TBG4 499 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SH2D3AQ9BRG2 576 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM121Q9BTD3 319 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 KIF1AQ12756 1690 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 F8W8V4 182 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 H0YIN7 160 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PTK7Q13308 1070 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 KIF22Q14807 665 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SYDE2Q5VT97 1194 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 AMIGO2Q86SJ2 522 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PPM1NQ8N819 430 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ZFP28Q8NHY6 868 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF398Q8TD17 642 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CFAP36Q96G28 342 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CSRNP1Q96S65 589 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CCT7Q99832 543 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SENP7Q9BQF6 1050 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ANO3Q9BYT9 981 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 GPR88Q9GZN0 384 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 USP29Q9HBJ7 922 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SELENONQ9NZV5 590 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 MINPP1Q9UNW1 487 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PCSK6P29122 969 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 UBXN2AP68543 259 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 GAD2Q05329 585 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 FOXR2Q6PJQ5 311 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 NUDCD3Q8IVD9 361 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 EPS8L1Q8TE68 723 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 FAM84AQ96KN4 292 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC28BQ9BUN5 200 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 STK32BQ9NY57 414 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 E5RJQ4 531 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TYROBPO43914 113 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 GCAP28676 217 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PDK1Q15118 436 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 MYLK3Q32MK0 819 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ATP11CQ8NB49 1132 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 RNF169Q8NCN4 708 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 FAM172AQ8WUF8 416 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SKA1Q96BD8 255 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 FAM81BQ96LP2 452 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 RAB20Q9NX57 234 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 NOP56O00567 594 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ADCY6O43306 1168 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 MAGEC1O60732 1142 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 NSFP46459 744 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 VAMP7P51809 220 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ITGA9Q13797 1035 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 FAM182BQ5T319 152 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 DEFB107AQ8IZN7 70 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 FBXO36Q8NEA4 188 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CAAP1Q9H8G2 361 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 THEGQ9P2T0 379 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SOX13Q9UN79 622 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 E2F6O75461 281 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 POLD1P28340 1107 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 STT3AP46977 705 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms