RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264318.3

GABRA4-201, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GABRA4, Length 11,973 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4-201ENST00000264318 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 EPC2Q52LR7 807 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ZNF354CQ86Y25 554 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 DNM3Q9UQ16 869 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 KDM5BQ9UGL1 1544 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 HLA-DPA1P20036 260 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ETV3P41162 512 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 GPC3P51654 580 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 GSTM4Q03013 218 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 NLRP10Q86W26 655 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ABCG2Q9UNQ0 655 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ASXL2Q76L83 1435 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 RFX7Q2KHR2 1363 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 CHRNB1P11230 501 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 FOSL2P15408 326 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 LRP8Q14114 963 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 MDH1BQ5I0G3 518 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 CAMK1DQ8IU85 385 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 SLC22A8Q8TCC7 542 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 SPATA2Q9UM82 520 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ASB3Q9Y575 518 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 E9PBE3 544 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 PJA2O43164 708 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 CCNE2O96020 404 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 HERC3Q15034 1050 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 SPDYAQ5MJ70 313 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 AHI1Q8N157 1196 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 BBS5Q8N3I7 341 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 MIGA1Q8NAN2 632 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 LILRB4Q8NHJ6 448 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 GCNAQ96QF7 691 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 EYA4O95677 639 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 TPBGLP0DKB5 382 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 GTF2H1P32780 548 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ACVR2BQ13705 512 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 PRPSAP1Q14558 356 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 CENPSQ8N2Z9 138 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 POU5F2Q8N7G0 328 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 RAB2BQ8WUD1 216 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 CEP170Q5SW79 1584 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 BTBD19C9JJ37 291 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 SLC4A1P02730 911 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 GYS1P13807 737 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ITIH2P19823 946 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 SOX11P35716 441 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ARL13BQ3SXY8 428 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 HDAC11Q96DB2 347 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 IGSF9Q9P2J2 1179 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 HSMCR30P0CW71 290 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 DBTP11182 482 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 RPA1P27694 616 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 KRT25Q7Z3Z0 450 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 PIK3C3Q8NEB9 887 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 AFG1LQ8WV93 481 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 TCEAL3Q969E4 200 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 AP4B1Q9Y6B7 739 aa10.07□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 AIM2O14862 343 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 DSTNP60981 165 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 SFRP1Q8N474 314 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 PIDD1Q9HB75 910 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 VPS54Q9P1Q0 977 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 MYO5BQ9ULV0 1848 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ANKRD49Q8WVL7 239 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 SORCS3Q9UPU3 1222 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 TRIM49BA6NDI0 452 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 BTBD11A6QL63 1104 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 TRIM49D1C9J1S8 452 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 USP11P51784 963 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 RAD51Q06609 339 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 MEI1Q5TIA1 1274 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 EMC10Q5UCC4 262 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 SPOPLQ6IQ16 392 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 RFFLQ8WZ73 363 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 HIF1AQ16665 826 aa10.06□□□□□ -0.8
GABRA4-201ENST00000264318 GARNL3Q5VVW2 1013 aa10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms