RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259006.7

LIMD2-201, Transcript of LIM domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD2, Length 3,193 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2-201ENST00000259006 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 BTBD7Q9P203 1132 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CCNB1P14635 433 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 TCF4P15884 667 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 TAS2R40P59535 323 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 SP4Q02446 784 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 SPARCL1Q14515 664 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CCDC125Q86Z20 511 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 PLVAPQ9BX97 442 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 DMAC2Q9NW81 257 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 ARMCX1Q9P291 453 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 GGPS1O95749 300 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 PDGFRBP09619 1106 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 COL6A2P12110 1019 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 ATP2B4P23634 1241 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 GPS1Q13098 491 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 CYP1B1Q16678 543 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 NRG4Q8WWG1 115 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 NACC1Q96RE7 527 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 DRC3Q9H069 523 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 FSCN2O14926 492 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 IL1R1P14778 569 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 PRELPP51888 382 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 CLUL1Q15846 466 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 ERLEC1Q96DZ1 483 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 CYTH2Q99418 400 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 GAKO14976 1311 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 SSTR1P30872 391 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 ARPC4P59998 168 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 CDR2Q01850 454 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 SLC15A2Q16348 729 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 VPS52Q8N1B4 723 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 CAPN9O14815 690 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 RXRGP48443 463 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 ARSEP51690 589 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 MFAP3P55082 362 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 MAPK6Q16659 721 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 ZNF394Q53GI3 561 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 LRRC6Q86X45 466 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 MBOAT7Q96N66 472 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 TBX3O15119 743 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 ZBTB7AO95365 584 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 COG7P83436 770 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 TTC7BQ86TV6 843 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 TRABD2AQ86V40 505 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 STKLD1Q8NE28 680 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 FBXO41Q8TF61 875 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 SNX27Q96L92 541 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 MIPEPQ99797 713 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 HEY2Q9UBP5 337 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 TIMM22Q9Y584 194 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 NT5C2P49902 561 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 ARFIP2P53365 341 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 MTMR2Q13614 643 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMD2-201ENST00000259006 LRRC36Q1X8D7 754 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms