RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251303.10

SLX1A-201, Transcript of SLX1 homolog A, structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLX1A, Length 1,091 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1A-201ENST00000251303 HHIPQ96QV1 700 aa20.51■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 PARVGQ9HBI0 331 aa20.51■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.5■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.5■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 FRYQ5TBA9 3013 aa20.5■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 TRAK2O60296 914 aa20.5■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 FAM13AO94988 1023 aa20.5■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 ACOT2P49753 483 aa20.5■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 TXNDC8Q6A555 127 aa20.5■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 TCEAL6Q6IPX3 200 aa20.5■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 TCEAL3Q969E4 200 aa20.5■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 FIZ1Q96SL8 496 aa20.5■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 SLC26A4O43511 780 aa20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 GJA4P35212 333 aa20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 GALK1P51570 392 aa20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 GTF2BQ00403 316 aa20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 PDGFRLQ15198 375 aa20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 FBXO43Q4G163 708 aa20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 RNF43Q68DV7 783 aa20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 MON1AQ86VX9 555 aa20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 DPP3Q9NY33 737 aa20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.49■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 TISP43B9A030 160 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 TADA3O75528 432 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 ABCD1P33897 745 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 GPR15P49685 360 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 ELF2Q15723 593 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 MCTP1Q6DN14 999 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 SYT13Q7L8C5 426 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 STKLD1Q8NE28 680 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 AK8Q96MA6 479 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 EDEM2Q9BV94 578 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 EBF1Q9UH73 591 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.48■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 KPNA7A9QM74 516 aa20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 CSH1P0DML2 217 aa20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 CSH2P0DML3 217 aa20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 MTF1Q14872 753 aa20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 SV2CQ496J9 727 aa20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 ADALQ6DHV7 355 aa20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 CPA6Q8N4T0 437 aa20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 EXOC4Q96A65 974 aa20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 ECT2Q9H8V3 914 aa20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 CEP295Q9C0D2 2601 aa20.47■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 DCLK1O15075 740 aa20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 RHOBTB1O94844 696 aa20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 APBB3O95704 486 aa20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 PROS1P07225 676 aa20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 TSPY1Q01534 308 aa20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 DMC1Q14565 340 aa20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF77Q15935 545 aa20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 CD101Q93033 1021 aa20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 ACDQ96AP0 544 aa20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 CALML4Q96GE6 196 aa20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF560Q96MR9 790 aa20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 KIF2CQ99661 725 aa20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 KIF3AQ9Y496 699 aa20.46■□□□□ 0.87
SLX1A-201ENST00000251303 NOL4O94818 638 aa20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 CAVIN2O95810 425 aa20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 CREB5Q02930 508 aa20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 USP4Q13107 963 aa20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 MCM6Q14566 821 aa20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SLX1A-201ENST00000251303 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms