RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 SURF1Q15526 300 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF233A6NK53 670 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 PRAMEF12O95522 483 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 SOX9P48436 509 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 LHX1P48742 406 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 MYO1EQ12965 1108 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 CXorf38Q8TB03 319 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 ABCB6Q9NP58 842 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 F11P03951 625 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 TDGF1P13385 188 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 CTHP32929 405 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 AVPR1AP37288 418 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 NLRP12P59046 1061 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 DPH6Q7L8W6 267 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 IQUBQ8NA54 791 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 TTC8Q8TAM2 541 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 INTS13Q9NVM9 706 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 GPR179Q6PRD1 2367 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 CUTAO60888 179 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 YEATS4O95619 227 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 TNNC2P02585 160 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 PCSK1P29120 753 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 E2F4Q16254 413 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 RMDN1Q96DB5 314 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM9Q9C026 710 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 SIX4Q9UIU6 781 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 GABRDO14764 452 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 CYP2F1P24903 491 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 GAS6Q14393 721 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 DDR2Q16832 855 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 MON1AQ86VX9 555 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 DHX58Q96C10 678 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 GKN1Q9NS71 199 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 RAB23Q9ULC3 237 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 GPR15P49685 360 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 ASIC1P78348 528 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 SATB1Q01826 763 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 TNK2Q07912 1038 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.212e-9■■□□□ 12.1
NEDD8-201ENST00000250495 PON2Q15165 354 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 OSTM1Q86WC4 334 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 HPS3Q969F9 1004 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 SNX21Q969T3 373 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 HPDLQ96IR7 371 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 FAM84AQ96KN4 292 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 PKMYT1Q99640 499 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 TDP1Q9NUW8 608 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 AMPD2Q01433 879 aa22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.58■■□□□ 1.21
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