RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.29■■□□□ 1.16
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ODC1-201ENST00000234111 ALDH1B1P30837 517 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 GAD2Q05329 585 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 NADK2Q4G0N4 442 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.28■■□□□ 1.16
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ODC1-201ENST00000234111 DENND3A2RUS2 1198 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 TMEM221A6NGB7 291 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 ADRA2BP18089 450 aa22.28■■□□□ 1.16
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ODC1-201ENST00000234111 TAS2R40P59535 323 aa22.28■■□□□ 1.16
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ODC1-201ENST00000234111 ODR4Q5SWX8 454 aa22.28■■□□□ 1.16
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ODC1-201ENST00000234111 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.28■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.28■■□□□ 1.16
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ODC1-201ENST00000234111 A0A088AWK7 358 aa22.27■■□□□ 1.16
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ODC1-201ENST00000234111 DHRS4L1P0CG22 281 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 AKR1B1P15121 316 aa22.27■■□□□ 1.16
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ODC1-201ENST00000234111 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 AAGABQ6PD74 315 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 CHSY1Q86X52 802 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 TPH2Q8IWU9 490 aa22.27■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa22.27■■□□□ 1.16
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ODC1-201ENST00000234111 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.27■■□□□ 1.16
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ODC1-201ENST00000234111 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.26■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 ATP2A1O14983 1001 aa22.26■■□□□ 1.15
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ODC1-201ENST00000234111 LIASO43766 372 aa22.26■■□□□ 1.15
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ODC1-201ENST00000234111 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 BTBD7Q9P203 1132 aa22.26■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 POLIQ9UNA4 740 aa22.26■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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ODC1-201ENST00000234111 MXI1P50539 228 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 SLC25A3Q00325 362 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 HIC1Q14526 733 aa22.25■■□□□ 1.15
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ODC1-201ENST00000234111 HIPK4Q8NE63 616 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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ODC1-201ENST00000234111 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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ODC1-201ENST00000234111 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 MEIS2O14770 477 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 AP1G1O43747 822 aa22.25■■□□□ 1.15
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ODC1-201ENST00000234111 KITP10721 976 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 ATP6V1B1P15313 513 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.25■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.25■■□□□ 1.15
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