RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Crlf3Q9Z2L7 442 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tubb1A2AQ07 451 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zscan4dA7KBS4 506 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc17E9PVB5 1198 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Galnt4O08832 578 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ift81O35594 676 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aoc3O70423 765 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nr3c1P06537 783 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Drg1P32233 367 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SftpbP50405 377 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Yy1Q00899 414 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cntn3Q07409 1028 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ugt3a1Q3UP75 523 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zscan4fQ3URS2 506 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ubn1Q4G0F8 1135 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr18Q4VBE8 431 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spdye4aQ5IBH6 268 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pik3r5Q5SW28 871 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 2700097O09RikQ6PGK3 301 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam185aQ7TPD2 378 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zscan4cQ80VJ6 506 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chmp2bQ8BJF9 213 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snx30Q8CE50 437 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arfip2Q8K221 341 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wrap53Q8VC51 532 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acot11Q8VHQ9 594 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BrdtQ91Y44 956 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nek8Q91ZR4 698 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc25a11Q9CR62 314 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taf7lQ9D3R9 471 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DpysQ9EQF5 519 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rdh14Q9ERI6 334 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc22Q9JIG7 627 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cntn6Q9JMB8 1028 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nupr1Q9WTK0 80 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Asb1Q9WV74 336 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PatjQ63ZW7 1834 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Morc3F7BJB9 942 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp715G3X9T1 886 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Per1O35973 1291 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Impa1O55023 277 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pias1O88907 651 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp42P22227 288 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NcstnP57716 708 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arl4cP61208 192 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PhbP67778 272 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GabpaQ00422 454 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Srebf2Q3U1N2 1130 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2j11Q3UNV2 504 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abi3bpQ59IW6 1179 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ugt1a1Q63886 535 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tdpoz2Q717B2 364 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trpm4Q7TN37 1213 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CyldQ80TQ2 952 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc39bQ8BYY4 617 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SowahcQ8C0J6 512 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpc5Q8CAL5 572 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dhx36Q8VHK9 1001 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rabep2Q91WG2 554 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AslQ91YI0 464 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tekt2Q922G7 430 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GrapQ9CX99 217 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Paip2Q9D6V8 124 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc13a1Q9JHI4 594 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Anxa9Q9JHQ0 345 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rilpl1Q9JJC6 406 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc8a3S4R2P9 928 aa6.93□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plcg1Q62077 1302 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgef10Q8C033 1345 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tcp11x2A2AEI7 503 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adgrf2E9Q4J9 644 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DffaO54786 331 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gnat1P20612 350 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AmhP27106 555 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdcd2P46718 343 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pms2P54279 859 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Npas2P97460 816 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grb7Q03160 535 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgap45Q3TBD2 1116 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc127Q3TC33 260 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tgfbrap1Q3UR70 860 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B3gnt3Q5JCS9 372 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PterQ60866 349 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acvrl1Q61288 502 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Insm1Q63ZV0 521 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kif11Q6P9P6 1052 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dzip3Q7TPV2 1204 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NfascQ810U3 1240 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taf2Q8C176 1104 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Exd1Q8CDF7 570 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lonp1Q8CGK3 949 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim60Q8VI40 466 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdha3Q91Y16 942 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nxf1Q99JX7 618 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ssu72Q9CY97 194 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29 ms